More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2252 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2252  Transcriptional regulators-like protein  100 
 
 		 364 aa  712    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1699  GntR family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173754  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03440  transcriptional regulator  42.33 
 
 		 373 aa  186  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4061  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  37.8 
 
 		 361 aa  180  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2682  regulatory protein DeoR  37.91 
 
 		 378 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191466  normal  0.937043 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2737  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  30.99 
 
 		 364 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3563  regulatory protein DeoR  36.47 
 
 		 387 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2923  regulatory protein DeoR  37.57 
 
 		 362 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21330  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 383 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149427  normal  0.181929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0623  regulatory protein DeoR  33.33 
 
 		 354 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.369416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3811  regulatory protein DeoR  38.16 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.333022  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2905  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  30.85 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.532427  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2901  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  30.89 
 
 		 375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29000  transcriptional regulator  36.39 
 
 		 377 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  28.1 
 
 		 368 aa  146  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0673  regulatory protein GntR HTH  30.59 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3470  regulatory protein GntR HTH  26.94 
 
 		 364 aa  139  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000106127  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1012  regulatory protein GntR, HTH  25.71 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0226  GntR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0851  GntR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0546465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0301  regulatory protein GntR HTH  25.23 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.814124  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0485  GntR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 365 aa  119  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00291499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  32.31 
 
 		 368 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0649  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.34 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.174613  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3979  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  31.99 
 
 		 366 aa  113  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562885  normal  0.577756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  33.45 
 
 		 353 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  30.25 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  28.16 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2228  regulatory protein GntR HTH  25.64 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.916284  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  33.21 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  28.35 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  26.6 
 
 		 347 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  31.75 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  27.87 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2581  LacI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  25.08 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  30.5 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  26.24 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  31.16 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  34.04 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  32.29 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  31.12 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  31.25 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  30.77 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.85 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0710  transcriptional regulator, LacI family  31.53 
 
 		 334 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0832389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  30.82 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  27.96 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1374  transcriptional regulator, LacI family  32.16 
 
 		 357 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  28.93 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  29.41 
 
 		 357 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  31.69 
 
 		 357 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  29.24 
 
 		 334 aa  97.8  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  28.68 
 
 		 337 aa  97.8  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1478  transcriptional regulator, LacI family  31.67 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  28.21 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  29.64 
 
 		 337 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.02 
 
 		 333 aa  96.7  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 347 aa  96.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3749  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.11 
 
 		 344 aa  96.7  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  27.21 
 
 		 333 aa  96.7  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  28.02 
 
 		 333 aa  96.3  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  29.64 
 
 		 338 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2112  transcriptional regulator, LacI family  24.21 
 
 		 331 aa  95.9  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582425  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1220  transcriptional regulator, LacI family  25.52 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.485348 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  32.38 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  33.1 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  26.26 
 
 		 342 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  26.33 
 
 		 335 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  32.13 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  30.17 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 343 aa  94.4  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  29.37 
 
 		 343 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2646  transcriptional regulator, LacI family  32.38 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  31.05 
 
 		 335 aa  92.8  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6927  LacI family transcription regulator  32.39 
 
 		 345 aa  92.8  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  24.91 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  23.86 
 
 		 346 aa  92.4  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  28.67 
 
 		 346 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.91 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  28.67 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  24.91 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  24.91 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  24.91 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  28.52 
 
 		 343 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2163  transcriptional regulator, LacI family  33.11 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.130175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  24.91 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1562  LacI family transcription regulator  29.61 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2386  LacI family transcription regulator  30.18 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737452  normal  0.472555 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  25.18 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.12 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  28.52 
 
 		 343 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  28.52 
 
 		 343 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3040  transcriptional regulator, LacI family  33.1 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0128  transcriptional regulator, LacI family  32.81 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.531775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  32.36 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13850  transcriptional regulator, LacI family  30.04 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  24.82 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>