More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1699 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1699  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 392 aa  789    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2252  Transcriptional regulators-like protein  54.27 
 
 		 364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2682  regulatory protein DeoR  38.05 
 
 		 378 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191466  normal  0.937043 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4061  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  34.01 
 
 		 361 aa  162  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03440  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3563  regulatory protein DeoR  32.76 
 
 		 387 aa  154  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3811  regulatory protein DeoR  34.36 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.333022  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2923  regulatory protein DeoR  36.26 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21330  transcriptional regulator  33.62 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149427  normal  0.181929 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3470  regulatory protein GntR HTH  29.03 
 
 		 364 aa  136  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000106127  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2901  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  26.84 
 
 		 375 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2905  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  26.84 
 
 		 372 aa  132  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.532427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0623  regulatory protein DeoR  33.82 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.369416 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0851  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 359 aa  129  7.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0546465  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29000  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2737  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  26.95 
 
 		 364 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.19 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0485  GntR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00291499  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  26.68 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0673  regulatory protein GntR HTH  26.98 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.07 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  32.76 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  33.87 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  31.22 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  29.21 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  24.29 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0226  GntR family transcriptional regulator  22.72 
 
 		 362 aa  102  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3979  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  28.9 
 
 		 366 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562885  normal  0.577756 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0081  GntR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 533 aa  99.4  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0322745  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1012  regulatory protein GntR, HTH  26.17 
 
 		 342 aa  99.4  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  31.21 
 
 		 357 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  27.43 
 
 		 338 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  32.19 
 
 		 338 aa  96.3  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  27.17 
 
 		 334 aa  96.3  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  28.11 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  29.68 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  27.94 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2112  transcriptional regulator, LacI family  25.33 
 
 		 331 aa  94.4  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582425  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0649  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.98 
 
 		 318 aa  94.4  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.174613  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  29.06 
 
 		 353 aa  93.6  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0301  regulatory protein GntR HTH  22.82 
 
 		 353 aa  93.2  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.814124  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  29.61 
 
 		 333 aa  93.2  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.88 
 
 		 337 aa  93.2  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.57 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 334 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  29.77 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  28.77 
 
 		 342 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0927  LacI family transcription regulator  31.6 
 
 		 324 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.845689 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5078  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.08 
 
 		 337 aa  90.1  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0397942  normal  0.741474 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0363  LacI family transcription regulator  28.62 
 
 		 360 aa  89.7  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  29 
 
 		 336 aa  89.7  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  26.8 
 
 		 338 aa  89.4  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  31.71 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  27.09 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  26.9 
 
 		 352 aa  89.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  27.09 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  27.09 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  27.09 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1404  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.68 
 
 		 343 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00377783  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  27.22 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2376  transcriptional regulator, LacI family  28.86 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  28.98 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  26.46 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  25.22 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  30.75 
 
 		 334 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2228  regulatory protein GntR HTH  22.7 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.916284  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0710  transcriptional regulator, LacI family  27.54 
 
 		 334 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0832389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  27.12 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  23.82 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.72 
 
 		 347 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  31.03 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2059  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  26.78 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.256407  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  28.53 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  26.85 
 
 		 343 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  26.8 
 
 		 343 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  27.21 
 
 		 333 aa  87.4  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  26.8 
 
 		 343 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4738  alanine racemase  30.06 
 
 		 351 aa  87.4  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  26.93 
 
 		 340 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  26.8 
 
 		 343 aa  87  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  30.34 
 
 		 331 aa  87  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.62 
 
 		 356 aa  87  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 346 aa  87  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  26.8 
 
 		 334 aa  87  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 361 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  28.4 
 
 		 330 aa  86.7  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0519  LacI family transcription regulator  29.55 
 
 		 334 aa  87  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 		 347 aa  86.7  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  26.93 
 
 		 340 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  25.26 
 
 		 335 aa  86.3  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4142  LacI family transcription regulator  29.65 
 
 		 333 aa  86.3  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5512  transcriptional regulator, LacI family  25.93 
 
 		 340 aa  86.3  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0234887 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  28.75 
 
 		 330 aa  86.3  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2846  LacI family transcription regulator  29.83 
 
 		 326 aa  86.3  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  28.75 
 
 		 330 aa  86.3  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  27.35 
 
 		 336 aa  86.3  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  28.43 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  29.11 
 
 		 335 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  30.56 
 
 		 342 aa  85.9  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>