More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2059 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2059  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  100 
 
 		 382 aa  778    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.256407  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2750  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  49.72 
 
 		 379 aa  346  4e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0161564  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  28.88 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2905  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  27.17 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.532427  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2901  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  27.17 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  28.11 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2737  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  27.67 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0081  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 533 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0322745  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0851  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0546465  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0673  regulatory protein GntR HTH  25.71 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  27.86 
 
 		 346 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  28.17 
 
 		 346 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 340 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  27.08 
 
 		 347 aa  96.3  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  28.82 
 
 		 368 aa  96.3  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  29.54 
 
 		 337 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2261  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.13 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.276208 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  25.29 
 
 		 347 aa  93.6  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  27.14 
 
 		 333 aa  94  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  28.3 
 
 		 348 aa  93.2  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.87 
 
 		 328 aa  93.2  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2662  LacI family transcription regulator  31.73 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767927 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3381  transcriptional regulator, LacI family  27.96 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289071 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  26.87 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0710  transcriptional regulator, LacI family  30.89 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0832389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4008  transcriptional regulator, LacI family  25.8 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000985107  hitchhiker  0.00000124933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3679  transcriptional regulator, LacI family  27.66 
 
 		 340 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  23.81 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  27.03 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  28.9 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3542  transcriptional regulator, LacI family  24.42 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27690  transcriptional regulator  30.82 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5883  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.14 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.92391 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5702  transcriptional regulator, LacI family  24.48 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1699  GntR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173754  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.73 
 
 		 347 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2497  Alanine racemase  28.53 
 
 		 338 aa  87.8  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  29.17 
 
 		 353 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0301  regulatory protein GntR HTH  23.42 
 
 		 353 aa  86.3  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.814124  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  31.4 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  23.72 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5512  transcriptional regulator, LacI family  24.38 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0234887 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  26.65 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  30.09 
 
 		 336 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  29.73 
 
 		 331 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2860  putative transcription regulation repressor transcription regulator protein  28.52 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  25.08 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6639  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.08 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3470  regulatory protein GntR HTH  22.87 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000106127  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2742  transcriptional regulator, LacI family  29.29 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0297688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2252  Transcriptional regulators-like protein  28.28 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2228  regulatory protein GntR HTH  24.26 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.916284  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0285  alanine racemase  27.22 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  29.14 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3792  transcriptional regulator LacI family  26.91 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1574  transcriptional regulator, LacI family  26.27 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  28.61 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0352  transcriptional regulator, LacI family  23.55 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  28.49 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  26.07 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  23.97 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1775  transcriptional regulator, LacI family  26.9 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.443552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3266  transcriptional regulator, LacI family  22.71 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.030441 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  25.08 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2764  alanine racemase  24.84 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1012  regulatory protein GntR HTH  24.9 
 
 		 370 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.77 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1186  transcriptional regulator, LacI family  26.71 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0882106  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  27.59 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  28.68 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0926  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  27.47 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  28.12 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  26.88 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  23.64 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  25.76 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  25.15 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0984  transcriptional regulator, putative  26.92 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.879842  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  25.64 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3000  transcriptional regulator, LacI family  29.51 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  27.92 
 
 		 338 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  26.48 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1376  alanine racemase  26.6 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  24.04 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0779  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  20.43 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.561354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  23.51 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  27.25 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  23.17 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4257  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.36 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  27.1 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0485  GntR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00291499  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  28.68 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  27.27 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1248  transcriptional regulator, LacI family  24.64 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0782052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0802  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.93 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00486  transcriptional regulator LacI family  27.76 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1973  LacI family transcription regulator  27.22 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.768247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  28.08 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>