More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2750 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2750  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  100 
 
 		 379 aa  777    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0161564  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2059  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  49.72 
 
 		 382 aa  346  4e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.256407  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  27.09 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2737  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  29.46 
 
 		 364 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2901  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  26.26 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2905  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  27 
 
 		 372 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.532427  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  25.29 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  25.63 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0851  GntR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0546465  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  24.56 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  25.86 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.27 
 
 		 338 aa  106  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  25.39 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  27.04 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  27.99 
 
 		 333 aa  102  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.65 
 
 		 336 aa  102  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3470  regulatory protein GntR HTH  24.71 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000106127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1248  transcriptional regulator, LacI family  24.05 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0782052 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0485  GntR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 365 aa  102  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00291499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5512  transcriptional regulator, LacI family  23.94 
 
 		 340 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0234887 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2228  regulatory protein GntR HTH  24.07 
 
 		 370 aa  99.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.916284  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  28.03 
 
 		 346 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  27.75 
 
 		 346 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0301  regulatory protein GntR HTH  24.19 
 
 		 353 aa  97.4  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.814124  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0226  GntR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 362 aa  96.3  8e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0673  regulatory protein GntR HTH  25.71 
 
 		 351 aa  96.3  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  25.82 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  23.68 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  24.55 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  28.74 
 
 		 335 aa  95.1  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.92 
 
 		 330 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0081  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 533 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0322745  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  24.53 
 
 		 339 aa  94.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  27.69 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2290  transcriptional regulator, LacI family  28.21 
 
 		 344 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  25.9 
 
 		 342 aa  94  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  28.01 
 
 		 353 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  27.76 
 
 		 347 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0352  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  28.35 
 
 		 336 aa  93.2  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2261  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.05 
 
 		 348 aa  92.8  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.276208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2662  LacI family transcription regulator  29.62 
 
 		 328 aa  92.8  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  26.84 
 
 		 359 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3542  transcriptional regulator, LacI family  24.04 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  29.46 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2210  transcriptional regulator, LacI family  28.98 
 
 		 342 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  29.46 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  26.67 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  29.46 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.57 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  27.41 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0779  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.43 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.561354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  26.32 
 
 		 335 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 328 aa  91.3  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  29.46 
 
 		 330 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  23.38 
 
 		 333 aa  90.9  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  27.06 
 
 		 357 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 337 aa  90.5  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  26.81 
 
 		 323 aa  90.5  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1012  regulatory protein GntR HTH  26.38 
 
 		 370 aa  89.7  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3979  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  29.17 
 
 		 366 aa  89.7  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562885  normal  0.577756 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  25.54 
 
 		 341 aa  89.7  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  23.15 
 
 		 331 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  29.07 
 
 		 330 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  24.77 
 
 		 355 aa  89.4  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  26.71 
 
 		 358 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  27.08 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  26.24 
 
 		 354 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  27.08 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1148  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  21.18 
 
 		 336 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.907007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4253  LacI family transcription regulator  28.72 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  25.15 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  21.94 
 
 		 368 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1775  transcriptional regulator, LacI family  27.24 
 
 		 350 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.443552 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  26.51 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2742  transcriptional regulator, LacI family  29.57 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0297688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0624  LacI family transcription regulator  28.12 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.393739  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  29.07 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  26.74 
 
 		 347 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1756  transcriptional regulator, LacI family  30.37 
 
 		 357 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4950  putative LacI family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 341 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213435  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  29.07 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  26.79 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  26.51 
 
 		 323 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  23.91 
 
 		 333 aa  87  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 348 aa  86.7  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3107  transcriptional regulator, LacI family  29.18 
 
 		 331 aa  86.3  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  26.49 
 
 		 323 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  26.79 
 
 		 323 aa  86.3  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3761  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.81 
 
 		 338 aa  86.3  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  26.79 
 
 		 323 aa  86.3  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  26.79 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  26.82 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4257  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.62 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6639  transcriptional regulator, LacI family  28.46 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0665  transcriptional regulator, LacI family  24.47 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0509948  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  25.08 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  27.86 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  26.59 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  26.27 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>