More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0363 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0363  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 360 aa  733    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4142  LacI family transcription regulator  42.02 
 
 		 333 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4950  putative LacI family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213435  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0119  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.21 
 
 		 347 aa  190  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0810079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  33.92 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4672  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.04 
 
 		 340 aa  186  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4647  LacI family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 339 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0134194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.04 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.1 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.06 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 		 348 aa  169  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1198  LacI family transcription regulator  36.78 
 
 		 337 aa  169  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  31.86 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  31.61 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  32.45 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.82 
 
 		 356 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  31.4 
 
 		 365 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1769  LacI family transcription regulator  31.58 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  30.95 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  30.06 
 
 		 355 aa  156  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  28.87 
 
 		 341 aa  156  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  32.33 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  31.4 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  32.8 
 
 		 353 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  35.4 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  34.43 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0710  transcriptional regulator, LacI family  34.24 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0832389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  29.64 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  32.94 
 
 		 338 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  30.45 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  29.34 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  31.23 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  31.07 
 
 		 337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3367  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.42 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00871192 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  31.25 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  31.52 
 
 		 353 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3173  transcriptional regulator, LacI family  36.05 
 
 		 342 aa  146  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.579609 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  33.91 
 
 		 391 aa  146  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  29.13 
 
 		 336 aa  146  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1286  putative DNA-binding sucrose operon transcriptional repressor transcription regulator protein  28.99 
 
 		 344 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.597152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 346 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  32.44 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  33.43 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  31.06 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  30.06 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  32.07 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.57 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2720  transcriptional regulator, LacI family  31.98 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.687845  normal  0.476409 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0292  LacI family transcription regulator  29.2 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00151755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  29.45 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  31.94 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3091  LacI family transcription regulator  34.16 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  29.97 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  31.98 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  31.25 
 
 		 352 aa  143  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  34.08 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  28.45 
 
 		 333 aa  142  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  31.02 
 
 		 336 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6389  transcriptional regulator, LacI family  32.64 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5122  transcriptional regulator, LacI family  30.26 
 
 		 356 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.958101  normal  0.135885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  31.94 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  33.55 
 
 		 357 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1754  transcriptional regulator, LacI family  35.67 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000321603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  31.09 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  33.55 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1481  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.9 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  31.1 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  31.95 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.99 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  29.68 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  31.04 
 
 		 358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1025  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.71197  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.36 
 
 		 336 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  30.45 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  30.65 
 
 		 352 aa  140  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 335 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  32.52 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 		 353 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  31.2 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  31.2 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.2 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.2 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.2 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.2 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  31.2 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.9 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.4 
 
 		 337 aa  139  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.2 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 342 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1984  LacI family transcription regulator  29.94 
 
 		 360 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4620  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 		 349 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5418  transcriptional regulator, LacI family  30.26 
 
 		 356 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263593 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.9 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.5 
 
 		 342 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.2 
 
 		 341 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>