More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2682 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2682  regulatory protein DeoR  100 
 
 		 378 aa  737    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191466  normal  0.937043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03440  transcriptional regulator  38.08 
 
 		 373 aa  193  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2923  regulatory protein DeoR  39.89 
 
 		 362 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0623  regulatory protein DeoR  36.89 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.369416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21330  transcriptional regulator  37.98 
 
 		 383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149427  normal  0.181929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3811  regulatory protein DeoR  36.71 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.333022  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3563  regulatory protein DeoR  32.51 
 
 		 387 aa  182  9.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4061  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  35.87 
 
 		 361 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2252  Transcriptional regulators-like protein  37.91 
 
 		 364 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1699  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173754  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29000  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 377 aa  143  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2737  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  28.29 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  30.88 
 
 		 338 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  25.14 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  29.11 
 
 		 338 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  32.12 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  29.82 
 
 		 347 aa  97.8  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  31.4 
 
 		 353 aa  94  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  29.12 
 
 		 339 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.66 
 
 		 339 aa  92.8  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  29.17 
 
 		 353 aa  92.8  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  29.55 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0779  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.07 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.561354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  29.43 
 
 		 340 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  29.18 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  30.84 
 
 		 347 aa  91.3  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2905  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  24.33 
 
 		 372 aa  90.9  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.532427  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  24.5 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3470  regulatory protein GntR HTH  23.22 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000106127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.36 
 
 		 336 aa  90.1  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  27.15 
 
 		 337 aa  90.1  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  33.08 
 
 		 338 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  24.28 
 
 		 342 aa  89.7  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  28.86 
 
 		 336 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  29.65 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7452  LacI family transcription regulator  29.6 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.390478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0673  regulatory protein GntR HTH  28.17 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  30.82 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  29.25 
 
 		 335 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  28.62 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0802  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.43 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  27.85 
 
 		 334 aa  87.8  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  21.56 
 
 		 368 aa  87  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2901  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  23.92 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  26.88 
 
 		 335 aa  87  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  27.85 
 
 		 334 aa  86.7  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  28.49 
 
 		 340 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2210  transcriptional regulator, LacI family  27.63 
 
 		 342 aa  86.3  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  29.43 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2662  LacI family transcription regulator  30.85 
 
 		 328 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767927 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  28.9 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0495  LacI family transcription regulator  29.5 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0777  transcriptional regulator, LacI family  31.75 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000623929 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2581  LacI family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0851  GntR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0546465  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1374  transcriptional regulator, LacI family  30.42 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  24.43 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  30.1 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  31.01 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2511  transcriptional regulator, LacI family  32.57 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  27.85 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1478  transcriptional regulator, LacI family  30.46 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  23.78 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  32.75 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  29.41 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  31.3 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  29.15 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  30.3 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.3 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  30.3 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  27.56 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  29.63 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  30.3 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  30.3 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3107  transcriptional regulator, LacI family  31.03 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3040  transcriptional regulator, LacI family  32.59 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  25.28 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  30.14 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  33.68 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  27.27 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  24.86 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0710  transcriptional regulator, LacI family  28.38 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0832389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0649  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.11 
 
 		 318 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.174613  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  29.29 
 
 		 337 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  33.71 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  40.71 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  23.36 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2112  transcriptional regulator, LacI family  20.43 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582425  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  26.26 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0116  transcriptional regulator, LacI family  31.6 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  30.13 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3537  transcriptional regulator, LacI family  26.33 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.234016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.92 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  28.62 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1574  transcriptional regulator, LacI family  29.35 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  27 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  23.43 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  27.07 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>