More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4344 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4344  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 75 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3953  regulatory protein GntR, HTH  91.55 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3960  regulatory protein GntR, HTH  75 
 
 		 75 aa  110  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  49.25 
 
 		 242 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 243 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0259  regulatory protein GntR, HTH  53.45 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0311021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4773  regulatory protein GntR HTH  45.07 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0230746  decreased coverage  0.0000199602 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0724  transcriptional regulator, GntR family  44.62 
 
 		 244 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0482  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  40.28 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4331  regulatory protein GntR, HTH  43.66 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.157834  normal  0.0446909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8668  putative transcriptional regulator, GntR family  41.79 
 
 		 111 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  44.59 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 253 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  44.78 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  36.51 
 
 		 241 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5605  transcriptional regulator, GntR family  40.91 
 
 		 266 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 253 aa  53.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  39.06 
 
 		 253 aa  53.9  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  36.99 
 
 		 234 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 278 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  37.88 
 
 		 252 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 		 254 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 234 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0740  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 245 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3213  GntR-like  35.62 
 
 		 234 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  39.68 
 
 		 229 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5125  GntR domain-containing protein  35.62 
 
 		 234 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5154  GntR domain-containing protein  35.62 
 
 		 234 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 242 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 280 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 255 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3664  GntR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 249 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.514259  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0853  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 282 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.122159  hitchhiker  0.00270002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 274 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 246 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  41.54 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3895  putative transcriptional regulator  37.68 
 
 		 249 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.221719  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  37.66 
 
 		 255 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3401  GntR domain-containing protein  40.98 
 
 		 233 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  37.66 
 
 		 255 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 225 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6358  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2160  putative transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 274 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 274 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 274 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 274 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0479  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 234 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5072  GntR domain-containing protein  34.25 
 
 		 234 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 271 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 473 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1335  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 459 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0939  histidine utilization repressor  41.79 
 
 		 241 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.997369  normal  0.595643 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4549  GntR domain-containing protein  34.25 
 
 		 234 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  42.37 
 
 		 245 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3758  histidine utilization repressor  40.91 
 
 		 235 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0153453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0916  histidine utilization repressor  41.79 
 
 		 241 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0397561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0825  histidine utilization repressor  41.79 
 
 		 241 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  38.81 
 
 		 254 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 245 aa  50.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 255 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  38.1 
 
 		 229 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 376 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0884  histidine utilization repressor  41.79 
 
 		 241 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  38.81 
 
 		 254 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1109  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 446 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.176588 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03128  histidine utilization repressor  39.66 
 
 		 246 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 266 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1148  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 446 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.976845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 256 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 247 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  41.38 
 
 		 255 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 245 aa  50.8  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 266 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 274 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 332 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 266 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  37.7 
 
 		 243 aa  50.4  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 376 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 266 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0978  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 234 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 266 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  43.14 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 266 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0081  GntR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 533 aa  50.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0322745  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 315 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 278 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 251 aa  50.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 		 145 aa  50.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  33.85 
 
 		 274 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 234 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 264 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 267 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 245 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>