More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1078 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1078  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  487  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358733  hitchhiker  0.00355085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  63.27 
 
 		 241 aa  304  9.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4811  transcriptional regulator, GntR family  35.66 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0033  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  32.92 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  31.85 
 
 		 261 aa  91.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  30.42 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  29.48 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2558  transcriptional regulator PhnF  26.53 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  29.64 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  28.45 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.14 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  28.24 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  25.82 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 271 aa  62  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  24.79 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  27.46 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  26.25 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2250  transcriptional regulator GntR  24.69 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.412993  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3642  GntR family transcriptional regulator  20.98 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6454  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  25.63 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  25.32 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2581  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  24.38 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1763  GntR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.102189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8668  putative transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  24.79 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  21.4 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 145 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2760  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0304853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5172  histidine utilization repressor  25.94 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5049  histidine utilization repressor  25.86 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00586645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  20.66 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6358  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 127 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0157  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 454 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.790011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  27.91 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0366  histidine utilization repressor  25.94 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3837  transcriptional regulator, GntR family  22.48 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.10255  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1448  transcriptional regulator, GntR family  23.63 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3786  transcriptional regulator, GntR family  22.48 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1750  GntR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0970545  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  23.65 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 274 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4068  GntR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6916  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  26.16 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0429  histidine utilization repressor  25.85 
 
 		 248 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 274 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  30.07 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  25.71 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  39.29 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000682902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>