More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1448 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1448  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 241 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  25.4 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3004  transcriptional regulator, GntR family  25.61 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000311693  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  23.98 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  25.61 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  25.41 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  24.58 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  22.03 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  23.71 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  24.69 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  21.65 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  24.45 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2284  transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  22.98 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  36.62 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  24.47 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  24 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  24.27 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  21.74 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  23.63 
 
 		 288 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5849  GntR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499759  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  24.37 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  25.13 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  25.13 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9145  transcriptional regulator GntR family  23.87 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  23.25 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  26.19 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3786  transcriptional regulator, GntR family  24.51 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3837  transcriptional regulator, GntR family  24.51 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.10255  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 241 aa  52.4  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  39.62 
 
 		 253 aa  52.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 253 aa  52.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 243 aa  52  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4875  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 139 aa  52.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1078  GntR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 245 aa  52  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358733  hitchhiker  0.00355085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  23.51 
 
 		 259 aa  52  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  22.03 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  23.01 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  21.55 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  21.55 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4206  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  24.34 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  22.92 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0165  GntR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.899806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6358  transcriptional regulator, GntR family  44.23 
 
 		 127 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1740  transcriptional regulator, GntR family  22.9 
 
 		 288 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000284043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4590  GntR domain-containing protein  34.04 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.845166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2114  GntR domain-containing protein  34.04 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  23.62 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4185  GntR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  19.91 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3590  UbiC transcription regulator-associated domain protein  22.32 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  23.26 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0188  transcriptional regulator  26.39 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0560306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3055  regulatory protein GntR HTH  32.81 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15140  transcriptional regulator  24.66 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  21.74 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  20.87 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2768  GntR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  21.83 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  21.83 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  21.65 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0767  GntR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  26.36 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  23.97 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  20 
 
 		 270 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>