More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0165 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0165  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  472  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.899806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  61.84 
 
 		 234 aa  289  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 239 aa  121  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 243 aa  96.3  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 256 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  30.3 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  29.34 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  27.92 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  27.16 
 
 		 247 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 249 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  27.66 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  23.79 
 
 		 261 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  23.79 
 
 		 261 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7203  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 253 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.277726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  24.35 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 243 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 270 aa  88.2  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 249 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  27.95 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  24.35 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  27.36 
 
 		 278 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 249 aa  85.9  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 308 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 248 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  25.82 
 
 		 244 aa  85.5  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 		 248 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  25.42 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  23.04 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  23.04 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.79 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  25.79 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  27.39 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  25.75 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.79 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.79 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  26.29 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.34 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.79 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  25.79 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.79 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4635  transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000503298  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4999  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0264  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4576  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4595  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4984  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4956  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  23.4 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  23.4 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  23.4 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4971  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  23.4 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  23.4 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>