More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7034 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7034  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3114  putative transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.931834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  29.3 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 253 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  30.22 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  47.76 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  29.72 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  50 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0146  GntR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  23.7 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4185  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  26.46 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  47.69 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  47.69 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0767  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  27.69 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  45.57 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  45.07 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  26.72 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  41.94 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  24.44 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0402  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  49.12 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  49.12 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2287  transcriptional regulator, GntR family  41.43 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1934  transcriptional regulator, GntR family  41.43 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.127514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  49.12 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0763  transcriptional regulator, GntR family  42.65 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  46.38 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  49.12 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  49.12 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  44.44 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  49.12 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1339  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.344054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  49.12 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  46.38 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4875  transcriptional regulator, GntR family  32.58 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  49.12 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1012  regulatory protein GntR, HTH  40 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  23.95 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  39.36 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4783  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  44.12 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.113518 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3696  transcriptional regulator, GntR family protein  39.68 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  42.25 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  25.69 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  47.69 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  24.44 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  24.44 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0088  transcriptional regulator, GntR family  26.22 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0856057  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  44.07 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3470  regulatory protein GntR HTH  34.18 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000106127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  40.62 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  40.62 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  40.62 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  40.62 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2915  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  40.62 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  40.62 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  45 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  45 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  40.62 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4088  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199409  normal  0.0399057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>