More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4955 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4955  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 248 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.23 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 263 aa  92.4  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 258 aa  92  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  31.16 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  25.65 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0694  transcriptional regulator  34.63 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 242 aa  89  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 247 aa  89  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0151  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 271 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 274 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 258 aa  85.5  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 243 aa  85.5  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  31.33 
 
 		 241 aa  85.1  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0542  putative repressor protein PhnR  31.08 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.706261  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0129  UbiC transcription regulator-associated domain protein  29.36 
 
 		 579 aa  83.6  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.625714 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 376 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0543  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.464871  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  33.97 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  24.53 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  28.88 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0165  GntR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.899806  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  26.59 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  26.53 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04882  histidine utilization repressor  28.51 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000763  2-aminoethylphosphonate uptake and metabolism regulator  28.51 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  24.5 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2420  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.333552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.72 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  27.04 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1876  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>