More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1226 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1226  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.804907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8675  putative transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 157 aa  98.6  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1076  GntR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 151 aa  95.5  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0019673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2160  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  34.88 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  40.96 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  34.1 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4875  transcriptional regulator, GntR family  43.9 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  44.62 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  46.03 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0121  regulatory protein GntR, HTH  48.33 
 
 		 251 aa  62  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000430087  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0126  regulatory protein GntR HTH  48.33 
 
 		 251 aa  62  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0616081  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  46.03 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  49.23 
 
 		 237 aa  62  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  46.03 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  41.57 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  46.03 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  50 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  50 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  50 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  50 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  43.42 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  50 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  50 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  37.68 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  38.81 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  38.81 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000682902  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3509  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0033  GntR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  41.43 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  50 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  42.86 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0617  transcriptional regulator, GntR family  43.94 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2915  GntR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4083  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  45 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1509  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  39.56 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  45 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  45 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0881  GntR domain protein  41.89 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  45.21 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  37.97 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  34.91 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  41.94 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4206  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  49.25 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  41.94 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 547 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  37.23 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  34.91 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1409  transcriptional regulator, GntR family  49.21 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  44.78 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  40.24 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  47.69 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  44.26 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  37.21 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0574  GntR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.391885  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1260  GntR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  40.79 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  34.02 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  31.07 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  41.54 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3762  GntR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  44.62 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  39.02 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>