266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN01080 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006683  CNN01080  hypothetical protein  100 
 
 
603 aa  1235    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02861  F-box and WD40 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11870)  31.32 
 
 
656 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.714475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  29.22 
 
 
1454 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05593  F-box and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G11440)  26.48 
 
 
854 aa  99  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.47 
 
 
733 aa  94.7  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  27.85 
 
 
1523 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.85 
 
 
1652 aa  90.9  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.4 
 
 
1557 aa  90.5  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.33 
 
 
1868 aa  90.1  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  23.97 
 
 
589 aa  86.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  27.57 
 
 
1196 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  22.7 
 
 
657 aa  81.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  25.83 
 
 
728 aa  80.5  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06359  Sulfur metabolite repression control protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00659]  25.94 
 
 
678 aa  80.5  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.189769  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05517  cell division control protein Cdc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13030)  24.83 
 
 
1038 aa  80.1  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.181187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.96 
 
 
1163 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  27.49 
 
 
505 aa  75.5  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.16 
 
 
1474 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 
930 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  22.91 
 
 
1363 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.55 
 
 
618 aa  73.9  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  23.58 
 
 
418 aa  72  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.07 
 
 
1626 aa  71.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.12 
 
 
1364 aa  71.6  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06710  ubiquitin-protein ligase, putative  24.04 
 
 
1012 aa  71.6  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.994255  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  22.89 
 
 
782 aa  71.2  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5471  predicted protein  27.2 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.18 
 
 
677 aa  71.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.44 
 
 
630 aa  71.2  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  26.99 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  26.3 
 
 
1280 aa  71.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  26.35 
 
 
1443 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  23.61 
 
 
1236 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.69 
 
 
1240 aa  70.9  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  24.57 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  26.15 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  25.58 
 
 
578 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  22.61 
 
 
1214 aa  70.1  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11593  predicted protein  25.8 
 
 
324 aa  70.1  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  33.33 
 
 
1330 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.67 
 
 
1193 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.55 
 
 
947 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.06 
 
 
682 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  24.38 
 
 
1016 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  24.38 
 
 
1016 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  26.88 
 
 
928 aa  68.2  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  22.67 
 
 
1247 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.76 
 
 
1686 aa  67.8  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.55 
 
 
1598 aa  67.8  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 
1607 aa  68.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.62 
 
 
1076 aa  67.8  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.29 
 
 
1262 aa  67  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.51 
 
 
1072 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03960  WD-repeat protein, putative  30.77 
 
 
622 aa  66.6  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05450  conserved hypothetical protein  23.08 
 
 
523 aa  66.6  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.723357  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  24.71 
 
 
774 aa  65.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.7 
 
 
740 aa  65.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.51 
 
 
1072 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.1 
 
 
642 aa  66.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.47 
 
 
1760 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  23.65 
 
 
1831 aa  66.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  23.55 
 
 
344 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  26.94 
 
 
1229 aa  65.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  23.86 
 
 
696 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  23.87 
 
 
1190 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.87 
 
 
792 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.09 
 
 
1856 aa  65.1  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.4 
 
 
1481 aa  64.7  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2326  predicted protein  23.62 
 
 
363 aa  64.3  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.19 
 
 
1510 aa  64.3  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64825  SCF complex F-box protein MET30  30.27 
 
 
612 aa  64.3  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.138944 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  22.54 
 
 
434 aa  63.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.08 
 
 
1711 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83827  predicted protein  22.34 
 
 
789 aa  62.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0497188  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.08 
 
 
1684 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  21.25 
 
 
1242 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  23.1 
 
 
1661 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.15 
 
 
1599 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  26.4 
 
 
1100 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01208  Pre-mRNA-splicing factor prp46 (Pre-mRNA-processing protein 46) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BE22]  22.35 
 
 
452 aa  62  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.43 
 
 
698 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  24.9 
 
 
742 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  24.52 
 
 
443 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  25.78 
 
 
1807 aa  61.6  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  22.82 
 
 
1211 aa  61.6  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  22.3 
 
 
1209 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.76 
 
 
608 aa  61.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  23.86 
 
 
687 aa  61.2  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  23.1 
 
 
1221 aa  60.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85406  predicted protein  22.67 
 
 
780 aa  60.8  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.920544 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  23.75 
 
 
564 aa  60.5  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.92 
 
 
676 aa  60.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  22.46 
 
 
1411 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03780  conserved hypothetical protein  32.28 
 
 
695 aa  60.5  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  26.46 
 
 
1789 aa  60.5  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.35 
 
 
1583 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50593  predicted protein  21.07 
 
 
617 aa  60.1  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.594901  normal  0.592668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  24.91 
 
 
778 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.3 
 
 
576 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06217  F-box and WD repeat-containing protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12060)  22.34 
 
 
618 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.824291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>