131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA05100 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA05100  WD-repeat protein, putative  100 
 
 
687 aa  1419    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04800  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06910)  41.55 
 
 
660 aa  246  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.213896  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  35.04 
 
 
1211 aa  60.8  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  27.31 
 
 
1454 aa  60.5  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.33 
 
 
1188 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.51 
 
 
1557 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.83 
 
 
1240 aa  57.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  25.3 
 
 
1280 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.49 
 
 
1236 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  30.7 
 
 
826 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.94 
 
 
630 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  28.52 
 
 
1523 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.7 
 
 
1193 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  29.77 
 
 
1196 aa  54.7  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.11 
 
 
576 aa  54.7  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.98 
 
 
919 aa  54.7  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.22 
 
 
924 aa  54.3  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  26.29 
 
 
335 aa  54.3  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51666  polyadenylation factor I subunit 2  28.46 
 
 
541 aa  53.5  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.91 
 
 
1348 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.12 
 
 
1163 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  22.26 
 
 
947 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.35 
 
 
1583 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03960  WD-repeat protein, putative  23.9 
 
 
622 aa  53.1  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  29.1 
 
 
505 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  26.17 
 
 
1491 aa  53.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.19 
 
 
1868 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  30.16 
 
 
696 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.59 
 
 
943 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174955 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05593  F-box and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G11440)  25.22 
 
 
854 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.2 
 
 
1072 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 
1411 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  29.75 
 
 
1190 aa  51.6  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  30.43 
 
 
522 aa  51.6  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1339  WD-40 repeat-containing protein  30.89 
 
 
504 aa  51.2  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143259  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  30.25 
 
 
1242 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.2 
 
 
1072 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41144  predicted protein  30.83 
 
 
1295 aa  51.2  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.16252  normal  0.0548409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  23.92 
 
 
1373 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.11 
 
 
1686 aa  50.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2326  predicted protein  24.67 
 
 
363 aa  50.8  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02070  trp-asp repeats containing protein, putative  28.86 
 
 
757 aa  50.8  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.63 
 
 
676 aa  50.8  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  28.99 
 
 
1330 aa  50.8  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06197  Nuclear distribution protein nudF [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00664]  26.37 
 
 
444 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.992518 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  26.28 
 
 
1213 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.91 
 
 
930 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.19 
 
 
828 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  26.94 
 
 
1161 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  30.16 
 
 
1807 aa  49.3  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  25 
 
 
1484 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29215  predicted protein  28.32 
 
 
317 aa  48.9  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25989  predicted protein  29.46 
 
 
215 aa  49.3  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  24.65 
 
 
1217 aa  48.9  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1253  WD-40 repeat protein  24.8 
 
 
960 aa  48.9  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  22.86 
 
 
1160 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53294  Hypothetical WD-40 repeat protein  24.06 
 
 
1117 aa  48.5  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.149122  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  26.48 
 
 
1161 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  25.93 
 
 
1344 aa  48.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.69 
 
 
675 aa  48.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  27.63 
 
 
316 aa  48.1  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  25 
 
 
564 aa  48.1  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.36 
 
 
792 aa  48.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.36 
 
 
1363 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  30 
 
 
1652 aa  47.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.6 
 
 
898 aa  47.8  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  25.81 
 
 
574 aa  47.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 
1334 aa  47.4  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19794  Receptor of activated protein kinase C 1A, component of 40S small ribosomal subunit  25.23 
 
 
321 aa  47.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48240  Receptor of activated protein kinase C 1B, component of 40S small ribosomal subunit  25.23 
 
 
321 aa  47.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.164071 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  29.57 
 
 
1364 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.09 
 
 
1684 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 
677 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.65 
 
 
1076 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  28 
 
 
840 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  23.9 
 
 
728 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  25.4 
 
 
1304 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.63 
 
 
1858 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41794  predicted protein  26.84 
 
 
495 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0300608  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.1 
 
 
716 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  26.5 
 
 
402 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.04 
 
 
1547 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  27.36 
 
 
1190 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  26.32 
 
 
1443 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01286  Protein hir1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDU4]  22.09 
 
 
1004 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.472702 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02380  nuclear matrix protein NMP200, putative  24.5 
 
 
507 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.21 
 
 
682 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  29.91 
 
 
443 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.09 
 
 
608 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3024  predicted protein  23.41 
 
 
308 aa  46.6  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.575089  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  28.57 
 
 
461 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  23.36 
 
 
657 aa  46.2  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  30.36 
 
 
1164 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  37.84 
 
 
1247 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25.2 
 
 
1208 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.41 
 
 
1221 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32006  WD domain protein  25.96 
 
 
367 aa  45.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37533  predicted protein  26.23 
 
 
485 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15280  predicted protein  28.92 
 
 
534 aa  45.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  30.36 
 
 
1901 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>