More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0774 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0774  sensor protein  100 
 
 
124 aa  253  6e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1191  response regulator receiver domain-containing protein  98.39 
 
 
124 aa  249  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  38.52 
 
 
1014 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0191  histidine kinase  38.94 
 
 
531 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 
785 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4342  aerobic respiration control sensor protein ArcB  36.07 
 
 
779 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  37.93 
 
 
785 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  37.07 
 
 
785 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  37.07 
 
 
785 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  39.66 
 
 
942 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3789  aerobic respiration control sensor protein ArcB  36.07 
 
 
779 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00874982  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2108  hypothetical protein  36.92 
 
 
302 aa  77  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
846 aa  76.6  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
839 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554495  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  37.93 
 
 
778 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0688  histidine kinase  38.66 
 
 
691 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2133  hypothetical protein  36.43 
 
 
302 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
1005 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
1040 aa  75.9  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1723  response regulator receiver and Hpt phospho transfer protein  35.43 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59780  putative kinase sensor protein  35.14 
 
 
1084 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000030188  hitchhiker  3.75506e-17 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.93 
 
 
796 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
1234 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
873 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  34.48 
 
 
1023 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.1 
 
 
937 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.83 
 
 
933 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3631  aerobic respiration control sensor protein ArcB  36.07 
 
 
779 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330412  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0307  aerobic respiration control sensor protein ArcB  35.25 
 
 
789 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0739851  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  37.07 
 
 
783 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.52 
 
 
937 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1943  histidine kinase  36.75 
 
 
647 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.539019  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 
1202 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
1238 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  31.62 
 
 
588 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
1238 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
1238 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
1238 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
631 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  33.59 
 
 
1346 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.74 
 
 
235 aa  73.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  36.21 
 
 
785 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  36.28 
 
 
1407 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
921 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  37.14 
 
 
631 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  34.68 
 
 
833 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3017  RcsC  34.55 
 
 
1083 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0301  aerobic respiration control sensor protein ArcB  36.21 
 
 
789 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0737861  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  34.45 
 
 
620 aa  72  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0658  histidine kinase  33.33 
 
 
627 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.92 
 
 
1233 aa  72  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  35.77 
 
 
1214 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
759 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  31.4 
 
 
1060 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1911  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
787 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0413731  normal  0.503462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 
835 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1187  two component system histidine kinase  31.3 
 
 
683 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.572633  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0844  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  31.3 
 
 
669 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.644717  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  30.77 
 
 
578 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  37.07 
 
 
1200 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
899 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.618287  normal  0.57938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1204 aa  71.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4809  response regulator receiver protein  26.45 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  33.61 
 
 
786 aa  70.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4576  histidine kinase  30.58 
 
 
678 aa  70.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.354871 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  34.75 
 
 
1188 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
1236 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
784 aa  70.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3604  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 
1172 aa  70.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
1236 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
1236 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  35.65 
 
 
779 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  37.93 
 
 
772 aa  70.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
781 aa  70.5  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 
737 aa  70.5  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4293  multi-sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 
1011 aa  70.5  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.291525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
764 aa  70.5  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03688  Stress response regulator SrrA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J0P7]  36.21 
 
 
558 aa  70.5  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003077  autoinducer 1 sensor kinase/phosphatase luxN  35.9 
 
 
846 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.48 
 
 
1499 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 
827 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1674  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
890 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00434081  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  32 
 
 
905 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  35.09 
 
 
1683 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1695  GacS/BarA family sensor protein  35.9 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
865 aa  69.3  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.58 
 
 
929 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 
1057 aa  69.3  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
1226 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  36 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 
1326 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  34.48 
 
 
651 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
899 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0469  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.79 
 
 
778 aa  69.3  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.55831  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2689  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 
624 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
1333 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
916 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.16 
 
 
941 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3808  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 
808 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0284545  normal  0.136228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>