More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03015 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03015  putative ATP-binding component of ABC transporter protein  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1050  ABC transporter related  72.49 
 
 		 231 aa  344  5e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0182  ABC transporter related  58.22 
 
 		 232 aa  276  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1054  ABC transporter related protein  38.04 
 
 		 193 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  31.17 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  35.78 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  34.89 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  36.7 
 
 		 303 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  36.7 
 
 		 294 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  36.7 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  36.7 
 
 		 294 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  34.05 
 
 		 296 aa  122  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  36.7 
 
 		 294 aa  121  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  33.19 
 
 		 315 aa  121  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  34.3 
 
 		 299 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  34.3 
 
 		 299 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  31.2 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2323  ABC transporter related  32.19 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  36.77 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  36.24 
 
 		 303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  36.24 
 
 		 294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  34.1 
 
 		 244 aa  118  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  30.67 
 
 		 300 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  35.14 
 
 		 294 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  33.18 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.48 
 
 		 309 aa  116  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  32.63 
 
 		 293 aa  116  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0642  ABC transporter related  34.42 
 
 		 297 aa  116  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0145806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  30.51 
 
 		 331 aa  115  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  31.39 
 
 		 369 aa  115  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  35.32 
 
 		 303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  34.06 
 
 		 305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  31.48 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  32.88 
 
 		 317 aa  114  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0764  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  31.96 
 
 		 249 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000201929  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  35.11 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  31.2 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  34.23 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  32.74 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  32.89 
 
 		 296 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  32 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3330  ABC transporter related  33.04 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2129  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  30.04 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  34.42 
 
 		 307 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  32.57 
 
 		 339 aa  112  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  33.95 
 
 		 341 aa  111  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  30.04 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  29.03 
 
 		 316 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  31.76 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1721  ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  30.87 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  29.32 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  34.71 
 
 		 310 aa  109  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1678  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.87 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00600162  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2165  ABC transporter related protein  31.98 
 
 		 308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf625  ABC transporter ATP-binding protein  39.15 
 
 		 353 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.577  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1375  ABC transporter related  29.49 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  30.9 
 
 		 319 aa  108  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  34.07 
 
 		 293 aa  108  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6513  ABC transporter related  31.96 
 
 		 409 aa  108  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0552468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0576  ABC transporter related  29.33 
 
 		 264 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.490377  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  29.95 
 
 		 325 aa  108  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  32.03 
 
 		 295 aa  108  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2053  ABC transporter related  34.42 
 
 		 299 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0394425  normal  0.0287688 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1694  ABC transporter related  30.36 
 
 		 299 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  33.49 
 
 		 298 aa  108  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  33.78 
 
 		 259 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  31.7 
 
 		 297 aa  107  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  30.56 
 
 		 307 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  32.22 
 
 		 308 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  29.38 
 
 		 301 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 		 309 aa  107  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  32.59 
 
 		 302 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  31.33 
 
 		 360 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  30.49 
 
 		 327 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  31.34 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  29.38 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  30.8 
 
 		 252 aa  106  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  30.09 
 
 		 306 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  31.51 
 
 		 304 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1642  ABC transporter related  32.17 
 
 		 308 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00844741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  31.46 
 
 		 300 aa  105  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  30.33 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0329  ABC transporter related  28.09 
 
 		 242 aa  105  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0007  ABC transporter related  32.56 
 
 		 435 aa  105  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  33.33 
 
 		 286 aa  105  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  32.42 
 
 		 315 aa  105  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  30.77 
 
 		 309 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  30.19 
 
 		 298 aa  105  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1615  ABC transporter-related protein  32.39 
 
 		 301 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.183501  hitchhiker  0.00912591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  32.11 
 
 		 338 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  31.67 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  31.48 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1530  ABC transporter related  31.56 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.653437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  30.09 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  32.57 
 
 		 301 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 294 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0316  ABC transporter related protein  28.37 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.815133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>