More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0182 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0182  ABC transporter related  100 
 
 
232 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03015  putative ATP-binding component of ABC transporter protein  58.22 
 
 
231 aa  276  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1050  ABC transporter related  55.65 
 
 
231 aa  270  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1054  ABC transporter related protein  40.54 
 
 
193 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  34.87 
 
 
287 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  34.23 
 
 
331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  34.36 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  36.53 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  34.98 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  35.35 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  31.28 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2369  ABC transporter related  35.65 
 
 
284 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.766502  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
306 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  33.48 
 
 
326 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  33.03 
 
 
302 aa  125  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  32.31 
 
 
325 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  35.75 
 
 
332 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  35.51 
 
 
299 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  36.54 
 
 
342 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  35.51 
 
 
299 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  34.43 
 
 
299 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  34.88 
 
 
306 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2704  ABC transporter related  31.1 
 
 
312 aa  123  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  33.18 
 
 
296 aa  122  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  33.94 
 
 
287 aa  122  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  33.33 
 
 
309 aa  121  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1530  ABC transporter related  34.25 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.653437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  31.25 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0764  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  31.13 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000201929  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  31.8 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  34.93 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  35.35 
 
 
340 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  31.78 
 
 
295 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  32.3 
 
 
294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  30.77 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  34.23 
 
 
305 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.88 
 
 
279 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0129  ABC transporter related  30.25 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  31.8 
 
 
294 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  31.72 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.18 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  31.34 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  34.09 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  31.78 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  34.51 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  31.34 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  32.11 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  31.78 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  31.16 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4581  ABC transporter related  32.59 
 
 
277 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  33.02 
 
 
337 aa  116  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4483  ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 
277 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  36.02 
 
 
305 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  28.7 
 
 
316 aa  116  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
305 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  33.93 
 
 
327 aa  116  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  32.2 
 
 
304 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  33.49 
 
 
303 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
257 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  32.63 
 
 
303 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  33.18 
 
 
307 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1249  ABC transporter related  29.02 
 
 
253 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.540719  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  32.63 
 
 
303 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  32.24 
 
 
319 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  33.94 
 
 
243 aa  115  6e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  33.04 
 
 
310 aa  115  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  30.53 
 
 
369 aa  115  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  28.96 
 
 
251 aa  115  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  34.05 
 
 
309 aa  115  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  30.41 
 
 
298 aa  115  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.63 
 
 
331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  32.63 
 
 
331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  33.49 
 
 
303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  32.58 
 
 
244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4648  ABC transporter ATP-binding protein  33.01 
 
 
277 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5003  ABC transporter ATP-binding protein  33.01 
 
 
277 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0797  ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 
234 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00354056  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  32.91 
 
 
300 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0358  ABC transporter related  31.3 
 
 
270 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  32.73 
 
 
288 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 
305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  30.52 
 
 
298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  30.88 
 
 
305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4501  ABC transporter, ATP-binding protein  33.01 
 
 
277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 
309 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 
305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  32.88 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 
309 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 
303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  33.64 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  32.58 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
298 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  31.11 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  30.52 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  31.53 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  31.31 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>