More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0764 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0764  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
249 aa  483  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000201929  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  38.14 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  33.73 
 
 
245 aa  158  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 
331 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  37.79 
 
 
327 aa  156  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  33.61 
 
 
303 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  35.91 
 
 
303 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.59 
 
 
256 aa  156  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  34.82 
 
 
303 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.82 
 
 
331 aa  154  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  33.2 
 
 
303 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  32.88 
 
 
316 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  34.82 
 
 
331 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  32.79 
 
 
303 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  34.09 
 
 
307 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  37.14 
 
 
311 aa  150  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  37.56 
 
 
304 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  30.67 
 
 
259 aa  149  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  33.18 
 
 
310 aa  149  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  31.53 
 
 
337 aa  149  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  32.33 
 
 
304 aa  148  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  34.42 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  33.02 
 
 
373 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  33.94 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  31.67 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  34.4 
 
 
297 aa  146  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  34.09 
 
 
305 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  34.56 
 
 
305 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  31.96 
 
 
250 aa  146  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  32.73 
 
 
306 aa  145  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  30.92 
 
 
309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  37 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  36.87 
 
 
305 aa  145  5e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  31.96 
 
 
287 aa  145  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 
305 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  32.08 
 
 
252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 
305 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 
305 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  36.24 
 
 
307 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
305 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 
305 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  33.49 
 
 
316 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  35.78 
 
 
307 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  33.64 
 
 
305 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  33.93 
 
 
356 aa  143  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  38.27 
 
 
309 aa  143  2e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  36.28 
 
 
266 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  38.18 
 
 
309 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  35.16 
 
 
309 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0007  ABC transporter related  38.89 
 
 
435 aa  143  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  37.85 
 
 
332 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  36.53 
 
 
305 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  33.49 
 
 
242 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1742  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 
238 aa  142  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.6629  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  34.56 
 
 
237 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  34.74 
 
 
247 aa  142  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  33.49 
 
 
256 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  35.14 
 
 
252 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  31.65 
 
 
339 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  33.18 
 
 
305 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.73 
 
 
309 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  36.7 
 
 
297 aa  142  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  31.03 
 
 
304 aa  142  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  34.88 
 
 
236 aa  142  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.27 
 
 
307 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  35.51 
 
 
252 aa  142  7e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 
241 aa  141  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  33.77 
 
 
241 aa  141  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  31.34 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  31.8 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  33.95 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  30.94 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  32.91 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0975  ABC transporter related  33.8 
 
 
391 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  35.81 
 
 
241 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  35.21 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.27 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  33.2 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  32.73 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.27 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  34.29 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3071  ABC transporter related protein  26.96 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.27 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5208  ABC transporter related protein  27.85 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  30.41 
 
 
292 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
241 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
241 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  32.37 
 
 
346 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  35.51 
 
 
241 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
241 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
273 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  36.57 
 
 
306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0710  ABC transporter related  31.84 
 
 
239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
369 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  33.04 
 
 
311 aa  139  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  32.57 
 
 
304 aa  139  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>