More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1054 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1054  ABC transporter related protein  100 
 
 
193 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0182  ABC transporter related  40.54 
 
 
232 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1050  ABC transporter related  37.1 
 
 
231 aa  149  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03015  putative ATP-binding component of ABC transporter protein  38.04 
 
 
231 aa  149  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1352  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  39.29 
 
 
369 aa  109  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.739461  normal  0.456479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  34.71 
 
 
392 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1848  choline transport ATP-binding protein opuBA  31.95 
 
 
382 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1602  choline transport ATP-binding protein opuBA  31.95 
 
 
382 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.844336  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1681  choline transport ATP-binding protein opuBA  31.95 
 
 
382 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.413883  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1593  choline transport ATP-binding protein opuBA  31.95 
 
 
382 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.108629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  34.52 
 
 
305 aa  104  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1661  choline transport ATP-binding protein OpuBA  31.95 
 
 
382 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2992  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  34.52 
 
 
400 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2530  ABC transporter related  37.35 
 
 
326 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  36.81 
 
 
295 aa  103  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5040  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  39.2 
 
 
392 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.187748 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  35.5 
 
 
299 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2120  spermidine/putrescine import ATP-binding protein  33.33 
 
 
376 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  30.46 
 
 
375 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  35.88 
 
 
323 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1055  ABC transporter related  35.96 
 
 
366 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1616  ABC proline/glycine betaine transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 
392 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1815  ABC transporter related  39.16 
 
 
326 aa  101  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  31.61 
 
 
375 aa  101  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  33.71 
 
 
227 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7658  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 
241 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133914  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3195  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  39.23 
 
 
389 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0913  choline ABC transporter ATP binding protein  33.89 
 
 
305 aa  100  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5172  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  39.23 
 
 
389 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00993584  normal  0.408818 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1797  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.65 
 
 
371 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5107  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  39.23 
 
 
389 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839045  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4811  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  39.43 
 
 
385 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.631339  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3485  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 
389 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.914246  normal  0.260672 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1921  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  31.55 
 
 
382 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  38.83 
 
 
308 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0149  ABC transporter related  35.06 
 
 
314 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7553  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  32.74 
 
 
391 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0455  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  38.12 
 
 
389 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144019  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15740  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  34.15 
 
 
335 aa  99.4  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3450  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
390 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5092  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  39.23 
 
 
389 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.571422 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4567  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  39.23 
 
 
389 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2313  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  29.31 
 
 
315 aa  99  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.499344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2099  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  29.89 
 
 
321 aa  99  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  33.14 
 
 
348 aa  98.6  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  35.09 
 
 
412 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2389  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  29.89 
 
 
315 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.301455  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0488  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  35.93 
 
 
376 aa  98.6  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00399049  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2076  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  35.09 
 
 
388 aa  98.6  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.545092 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2310  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  35.09 
 
 
408 aa  98.2  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.151652  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3063  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  30.46 
 
 
315 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2028  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  35.09 
 
 
412 aa  98.6  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.180465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2262  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  30.46 
 
 
315 aa  97.8  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.14 
 
 
299 aa  97.8  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  30.95 
 
 
351 aa  97.8  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2125  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  29.89 
 
 
315 aa  97.8  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2063  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  29.89 
 
 
315 aa  97.8  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.832322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2279  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  29.89 
 
 
315 aa  97.8  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.987599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2305  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  29.89 
 
 
315 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.264442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  31.95 
 
 
348 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0118  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  28.99 
 
 
378 aa  97.8  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.435278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  33.12 
 
 
363 aa  97.8  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0066  putative glycine betaine/L-proline ATP-binding ABC transporter protein  38.64 
 
 
385 aa  97.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2059  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  29.89 
 
 
315 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3696  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  37.65 
 
 
371 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0966  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 
581 aa  97.1  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  29.17 
 
 
349 aa  97.4  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  29.17 
 
 
303 aa  97.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3431  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.65 
 
 
371 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0622  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  37.06 
 
 
394 aa  97.1  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  28.74 
 
 
370 aa  96.7  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0564  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 
389 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0637892  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  32.74 
 
 
360 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  32.34 
 
 
298 aa  96.7  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.36 
 
 
256 aa  96.7  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0450  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  36.93 
 
 
389 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  34.16 
 
 
377 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  32.76 
 
 
376 aa  96.7  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3449  ABC transporter related  31.25 
 
 
363 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1933  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding subunit  36.93 
 
 
573 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1817  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  35.09 
 
 
412 aa  96.7  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.515107  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2027  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding subunit  36.93 
 
 
577 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1870  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 
389 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  34.15 
 
 
309 aa  96.3  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  34.16 
 
 
377 aa  97.1  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  34.16 
 
 
377 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0903  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 
577 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2238  ABC transporter related  35.57 
 
 
246 aa  96.3  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0769136  normal  0.0562594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0850  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.96 
 
 
345 aa  95.9  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6584  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  32.14 
 
 
392 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00553818  normal  0.0117418 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6102  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  32.14 
 
 
392 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  33.33 
 
 
324 aa  96.3  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  39.38 
 
 
346 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  32.74 
 
 
360 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0143  ABC transporter related  33.91 
 
 
314 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  39.38 
 
 
346 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.88 
 
 
264 aa  95.9  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  32.74 
 
 
360 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  39.38 
 
 
346 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  31.36 
 
 
305 aa  95.5  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>