More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1352 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1352  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
369 aa  738    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.739461  normal  0.456479 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0488  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.53 
 
 
376 aa  345  5e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00399049  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2913  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.73 
 
 
371 aa  295  9e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.362905 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1154  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  52.59 
 
 
318 aa  289  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2354  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  51.94 
 
 
393 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.08 
 
 
370 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  53.52 
 
 
375 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18440  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  53.12 
 
 
377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00065366  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.3 
 
 
379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2051  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54 
 
 
370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1276  ABC transporter related  52.82 
 
 
321 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5105  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42 
 
 
371 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.116998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1635  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.03 
 
 
397 aa  280  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.839045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1622  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.44 
 
 
398 aa  280  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  53.33 
 
 
392 aa  279  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3109  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.51 
 
 
389 aa  278  9e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0909  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  57.63 
 
 
335 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00640  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  53.73 
 
 
386 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.253633  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3334  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  39.94 
 
 
376 aa  277  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0347475  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4151  ABC transporter related protein  52.85 
 
 
389 aa  278  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2992  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  46.25 
 
 
400 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001530  L-proline Glycine Betaine ABC transport ATP-binding protein proV  49.81 
 
 
389 aa  276  5e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0771  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.93 
 
 
380 aa  276  5e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1921  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51 
 
 
382 aa  275  7e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.95 
 
 
375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7553  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  42.78 
 
 
391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4756  ABC transporter related protein  51.97 
 
 
328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0577  ABC transporter related  50.35 
 
 
334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000339076  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1661  choline transport ATP-binding protein OpuBA  46.23 
 
 
382 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1602  choline transport ATP-binding protein opuBA  46.23 
 
 
382 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.844336  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1593  choline transport ATP-binding protein opuBA  46.23 
 
 
382 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.108629 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1848  choline transport ATP-binding protein opuBA  46.23 
 
 
382 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1681  choline transport ATP-binding protein opuBA  46.23 
 
 
382 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.413883  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0985  ABC transporter related  50.35 
 
 
321 aa  272  6e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.997708  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0172  ABC transporter related  47.39 
 
 
310 aa  272  7e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4291  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.4 
 
 
351 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.603453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2493  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  48.82 
 
 
391 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167851  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2530  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.82 
 
 
391 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2538  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.82 
 
 
391 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0404434  normal  0.847899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  50.39 
 
 
324 aa  270  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  51.59 
 
 
376 aa  270  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37600  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  54.07 
 
 
353 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6102  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.41 
 
 
392 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6584  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.81 
 
 
392 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00553818  normal  0.0117418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1555  ABC transporter related protein  53.33 
 
 
445 aa  268  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1126  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.41 
 
 
367 aa  268  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4962  ABC transporter related  47.79 
 
 
328 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2245  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.74 
 
 
370 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.4729  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4886  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.45 
 
 
382 aa  266  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  0.719773 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0537  glycine betaine/L-proline transport, ATP-binding protein  38.52 
 
 
378 aa  265  7e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418471  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15740  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  47.06 
 
 
335 aa  264  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0868  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.56 
 
 
385 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0898  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.56 
 
 
385 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706016  normal  0.516388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3117  ABC transporter related  53.75 
 
 
312 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0287879  normal  0.0491103 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2358  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.57 
 
 
395 aa  263  4.999999999999999e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0521  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein  37.98 
 
 
378 aa  262  6e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.691197  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4310  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
385 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944105  normal  0.26992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0912  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.57 
 
 
385 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.195496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2493  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  43.52 
 
 
388 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957361  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0452  ABC transporter related  51.16 
 
 
344 aa  259  8e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4726  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.42 
 
 
364 aa  258  9e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.631244  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0186  ABC transporter related  50.42 
 
 
256 aa  258  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2523  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.04 
 
 
408 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0108992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2475  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.04 
 
 
408 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00846223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3265  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.8 
 
 
385 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2981  ABC transporter related  50.6 
 
 
317 aa  256  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0223  ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 
312 aa  256  6e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3511  ABC transporter related  52.34 
 
 
312 aa  256  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0214  ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 
312 aa  256  6e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2137  ABC transporter related  50 
 
 
312 aa  256  6e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2313  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  49.16 
 
 
315 aa  255  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.499344  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 
381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1033  ABC transporter related protein  53.97 
 
 
322 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0622  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.75 
 
 
394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2031  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.23 
 
 
418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.015462  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5139  ABC transporter related  49.43 
 
 
317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192374  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1081  ABC transporter related protein  54.22 
 
 
323 aa  253  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.136277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2530  ABC transporter related  50.39 
 
 
326 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3624  ABC transporter related  51.27 
 
 
314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3224  ABC transporter related  49.04 
 
 
317 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5143  ABC transporter related  49.04 
 
 
317 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310364  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0802  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  50.2 
 
 
398 aa  252  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0497  ABC proline/glycine betaine transporter, ATPase subunit  51.71 
 
 
312 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975936  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1329  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  54.24 
 
 
312 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.371543  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13580  ABC transporter ATP-binding protein  44 
 
 
387 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2784  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  54.24 
 
 
312 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2863  ABC transporter related  54.24 
 
 
312 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.466149  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4639  ABC transporter related  50.42 
 
 
312 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.493735  normal  0.263146 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0119  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.53 
 
 
369 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5061  ABC transporter related  51.71 
 
 
312 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0149  ABC transporter related  48.95 
 
 
314 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0268  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  51.65 
 
 
252 aa  250  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0118  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.06 
 
 
378 aa  250  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.435278  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1922  glycine betaine transport ATP-binding protein  51.65 
 
 
252 aa  250  3e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4537  ABC transporter related  51.28 
 
 
312 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67365  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0297  ABC transporter related  45.28 
 
 
312 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2059  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  48.32 
 
 
315 aa  249  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0143  ABC transporter related  47.5 
 
 
314 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2125  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  48.32 
 
 
315 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2063  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  48.32 
 
 
315 aa  249  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.832322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>