More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4639 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4639  ABC transporter related  100 
 
 		 312 aa  627  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.493735  normal  0.263146 
 
 
-
 
NC_004310  BR0223  ABC transporter, ATP-binding protein  64.95 
 
 		 312 aa  421  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0214  ABC transporter, ATP-binding protein  64.95 
 
 		 312 aa  421  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0297  ABC transporter related  65.27 
 
 		 312 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1580  amine ABC transporter, ATP-binding protein  58.52 
 
 		 312 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1974  amine ABC transporter, ATP-binding protein  58.52 
 
 		 312 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1140  ABC transporter, ATP-binding protein  58.52 
 
 		 312 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0408912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2132  ABC transporter, ATP-binding protein  58.52 
 
 		 312 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314823  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2380  ABC transporter, ATP-binding protein  59.81 
 
 		 312 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.850605  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0920  amine ABC transporter, ATP-binding protein  58.52 
 
 		 312 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0239  amine ABC transporter, ATP-binding protein  58.52 
 
 		 312 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.46205  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0497  ABC proline/glycine betaine transporter, ATPase subunit  59.49 
 
 		 312 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4537  ABC transporter related  59.49 
 
 		 312 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5061  ABC transporter related  59.16 
 
 		 312 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1993  amine ABC transporter, ATP-binding protein  58.52 
 
 		 312 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3511  ABC transporter related  59.16 
 
 		 312 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0149  ABC transporter related  61.84 
 
 		 314 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0143  ABC transporter related  61.84 
 
 		 314 aa  362  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2383  ABC transporter component  61.04 
 
 		 333 aa  362  6e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5139  ABC transporter related  58.23 
 
 		 317 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3224  ABC transporter related  58.23 
 
 		 317 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5143  ABC transporter related  58.23 
 
 		 317 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4888  ABC transporter related  60.45 
 
 		 310 aa  354  8.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  hitchhiker  0.00773492 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0915  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  49.19 
 
 		 308 aa  297  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.530478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1518  ABC transporter related  48.87 
 
 		 308 aa  297  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02059  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  48.87 
 
 		 308 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02017  hypothetical protein  48.87 
 
 		 308 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2264  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  48.54 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0844  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 308 aa  293  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2418  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  48.87 
 
 		 308 aa  293  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1528  ABC transporter related protein  48.54 
 
 		 308 aa  292  6e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.917455  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3254  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 308 aa  291  7e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625793 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2401  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  48.24 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1154  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  48.09 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2728  ABC transporter related  49.51 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2352  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  48.24 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2509  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  48.24 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2308  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  48.24 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2397  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  48.24 
 
 		 315 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1447  ABC transporter-related protein  49.84 
 
 		 311 aa  288  7e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.908489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2945  ABC transporter related  43.43 
 
 		 354 aa  286  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00675888  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1856  ABC transporter related  48.04 
 
 		 310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.500244  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3117  ABC transporter related  48.23 
 
 		 312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0287879  normal  0.0491103 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0577  ABC transporter related  48.26 
 
 		 334 aa  281  8.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000339076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2784  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  49.52 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1329  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  49.52 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.371543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2863  ABC transporter related  49.52 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.466149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0985  ABC transporter related  48.26 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.997708  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4291  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.17 
 
 		 351 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.603453 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.72 
 
 		 375 aa  277  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0172  ABC transporter related  48.55 
 
 		 310 aa  276  4e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0316  ABC transporter related protein  55.92 
 
 		 244 aa  271  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4726  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.51 
 
 		 364 aa  271  8.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.631244  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1033  ABC transporter related protein  49.2 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2051  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.58 
 
 		 370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37600  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  49.5 
 
 		 353 aa  268  8.999999999999999e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4756  ABC transporter related protein  46.06 
 
 		 328 aa  266  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  46.28 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.04 
 
 		 370 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3624  ABC transporter related  47.86 
 
 		 314 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5204  ABC transporter related protein  50.93 
 
 		 270 aa  262  4.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.213509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  53.97 
 
 		 392 aa  261  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0909  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.48 
 
 		 335 aa  261  8e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.5 
 
 		 375 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2530  ABC transporter related  47.23 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2493  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  45.9 
 
 		 388 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957361  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00640  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  55 
 
 		 386 aa  259  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.253633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5105  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.85 
 
 		 371 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.116998 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.17 
 
 		 381 aa  257  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4151  ABC transporter related protein  53.73 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6271  ABC transporter related  52.19 
 
 		 360 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2981  ABC transporter related  45.19 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2523  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.26 
 
 		 408 aa  253  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0108992  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26260  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  51.98 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.560056  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2475  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.26 
 
 		 408 aa  253  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00846223  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2137  ABC transporter related  44.98 
 
 		 312 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2245  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.26 
 
 		 370 aa  252  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.4729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3565  ABC transporter related  46.26 
 
 		 333 aa  252  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.230396 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2992  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  43.35 
 
 		 400 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2557  ABC transporter related  52.8 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000431635 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1352  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.42 
 
 		 369 aa  251  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.739461  normal  0.456479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0546  ABC transporter related  48.57 
 
 		 368 aa  250  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136652  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1620  ABC transporter related  51.2 
 
 		 317 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0397  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  56.9 
 
 		 369 aa  249  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2913  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.78 
 
 		 371 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.362905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0478  ABC transporter related  50.4 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201964  hitchhiker  0.00297277 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18440  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.39 
 
 		 377 aa  249  5e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00065366  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  52.1 
 
 		 376 aa  249  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2358  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.46 
 
 		 395 aa  249  6e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1921  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.81 
 
 		 382 aa  248  7e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2668  ABC transporter related  48.87 
 
 		 346 aa  248  7e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.194568  normal  0.0593639 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2313  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  44.01 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.499344  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0622  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.13 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1341  ABC transporter related protein  53.23 
 
 		 373 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.675912  hitchhiker  0.000979367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0802  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  46.95 
 
 		 398 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30040  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  50 
 
 		 282 aa  246  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2389  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.301455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3087  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.76 
 
 		 435 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0730099  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7553  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  43.35 
 
 		 391 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1815  ABC transporter related  47.71 
 
 		 326 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>