More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1620 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1620  ABC transporter related  100 
 
 
317 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0478  ABC transporter related  79.34 
 
 
333 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201964  hitchhiker  0.00297277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1154  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  54.98 
 
 
318 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2981  ABC transporter related  55.82 
 
 
317 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0985  ABC transporter related  55.44 
 
 
321 aa  323  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.997708  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0577  ABC transporter related  55.44 
 
 
334 aa  322  4e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000339076  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15740  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  54.79 
 
 
335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18440  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.96 
 
 
377 aa  312  4.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00065366  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4291  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  55.21 
 
 
351 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.603453 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0119  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.37 
 
 
369 aa  306  4.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001530  L-proline Glycine Betaine ABC transport ATP-binding protein proV  50.35 
 
 
389 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0912  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.68 
 
 
385 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.195496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0898  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.34 
 
 
385 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706016  normal  0.516388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0868  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.34 
 
 
385 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4726  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  56.45 
 
 
364 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.631244  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1921  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.09 
 
 
382 aa  300  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37600  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  52.48 
 
 
353 aa  300  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2992  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  48.77 
 
 
400 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7553  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  54.44 
 
 
391 aa  298  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4310  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.17 
 
 
385 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944105  normal  0.26992 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2493  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  49.83 
 
 
388 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957361  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1661  choline transport ATP-binding protein OpuBA  45.82 
 
 
382 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6584  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.05 
 
 
392 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00553818  normal  0.0117418 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6102  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.21 
 
 
392 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.69 
 
 
370 aa  296  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1602  choline transport ATP-binding protein opuBA  45.51 
 
 
382 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.844336  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1681  choline transport ATP-binding protein opuBA  45.51 
 
 
382 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.413883  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1593  choline transport ATP-binding protein opuBA  45.51 
 
 
382 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.108629 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1848  choline transport ATP-binding protein opuBA  45.94 
 
 
382 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0172  ABC transporter related  55.41 
 
 
310 aa  293  4e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0802  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  48.9 
 
 
398 aa  292  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5105  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  53.46 
 
 
371 aa  292  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.116998 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2354  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  50.57 
 
 
393 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4886  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
382 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  0.719773 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.93 
 
 
375 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00640  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  54.8 
 
 
386 aa  288  7e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.253633  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2051  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.51 
 
 
370 aa  286  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4151  ABC transporter related protein  54.2 
 
 
389 aa  286  4e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1033  ABC transporter related protein  52.2 
 
 
322 aa  285  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0909  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.16 
 
 
335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  54.96 
 
 
376 aa  283  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2913  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.1 
 
 
371 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.362905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0397  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  59.29 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0149  ABC transporter related  49.49 
 
 
314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4249  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  46.23 
 
 
388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1635  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.4 
 
 
397 aa  282  5.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.839045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1622  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.8 
 
 
398 aa  281  7.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3109  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.12 
 
 
389 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  43.45 
 
 
324 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0223  ABC transporter, ATP-binding protein  50.49 
 
 
312 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4575  glycine betaine/choline OpuC ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 
385 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449322  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0214  ABC transporter, ATP-binding protein  50.49 
 
 
312 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0803  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  46.23 
 
 
386 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0426806  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2530  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.8 
 
 
391 aa  278  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2493  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  54.8 
 
 
391 aa  278  7e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2538  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.8 
 
 
391 aa  278  7e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0404434  normal  0.847899 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0771  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.78 
 
 
380 aa  278  8e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.46 
 
 
375 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49 
 
 
379 aa  277  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  55.42 
 
 
392 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4756  ABC transporter related protein  51.11 
 
 
328 aa  276  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3265  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  56.63 
 
 
385 aa  276  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0143  ABC transporter related  48.12 
 
 
314 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1555  ABC transporter related protein  53.01 
 
 
445 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2945  ABC transporter related  59 
 
 
354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00675888  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0452  ABC transporter related  57.54 
 
 
344 aa  273  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2530  ABC transporter related  49.3 
 
 
326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2728  ABC transporter related  50.85 
 
 
316 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2313  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  48.75 
 
 
315 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.499344  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0297  ABC transporter related  48.86 
 
 
312 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13580  ABC transporter ATP-binding protein  49.1 
 
 
387 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3117  ABC transporter related  51.81 
 
 
312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0287879  normal  0.0491103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0622  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.38 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02059  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  51.9 
 
 
308 aa  269  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02017  hypothetical protein  51.9 
 
 
308 aa  269  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4537  ABC transporter related  52.22 
 
 
312 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67365  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5061  ABC transporter related  52.22 
 
 
312 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0844  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  50.52 
 
 
308 aa  268  7e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2668  ABC transporter related  56.23 
 
 
346 aa  268  7e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.194568  normal  0.0593639 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2418  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  50.52 
 
 
308 aa  268  8e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1215  ABC transporter ATP-binding protein  49.1 
 
 
387 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1528  ABC transporter related protein  51.56 
 
 
308 aa  267  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.917455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1993  amine ABC transporter, ATP-binding protein  53.5 
 
 
312 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3254  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  50.52 
 
 
308 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1815  ABC transporter related  49.32 
 
 
326 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2245  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  55.42 
 
 
370 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.4729  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1518  ABC transporter related  50.52 
 
 
308 aa  267  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0915  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  50.52 
 
 
308 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.530478 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2262  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  48.75 
 
 
315 aa  266  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2264  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  51.56 
 
 
308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2305  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  48.33 
 
 
315 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.264442 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2125  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  48.33 
 
 
315 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2063  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  48.33 
 
 
315 aa  266  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.832322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2059  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  48.33 
 
 
315 aa  266  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2279  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  48.33 
 
 
315 aa  266  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.987599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3063  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  48.75 
 
 
315 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3511  ABC transporter related  52.56 
 
 
312 aa  266  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1341  ABC transporter related protein  60.24 
 
 
373 aa  266  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.675912  hitchhiker  0.000979367 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0546  ABC transporter related  60.48 
 
 
368 aa  265  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136652  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2389  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 
315 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.301455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>