More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2418 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2418  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 308 aa  624  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1528  ABC transporter related protein  98.7 
 
 		 308 aa  617  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.917455  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2264  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  98.38 
 
 		 308 aa  614  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0844  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  98.7 
 
 		 308 aa  615  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1518  ABC transporter related  98.38 
 
 		 308 aa  613  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3254  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  98.7 
 
 		 308 aa  616  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0915  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  98.7 
 
 		 308 aa  616  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.530478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02059  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  98.05 
 
 		 308 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02017  hypothetical protein  98.05 
 
 		 308 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2308  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  87.34 
 
 		 315 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2401  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  87.34 
 
 		 315 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2352  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  87.34 
 
 		 315 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2509  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  87.34 
 
 		 315 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2397  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  87.01 
 
 		 315 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2728  ABC transporter related  80.72 
 
 		 316 aa  502  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1447  ABC transporter-related protein  69.16 
 
 		 311 aa  415  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.908489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1856  ABC transporter related  64.05 
 
 		 310 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.500244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2863  ABC transporter related  66.67 
 
 		 312 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.466149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2784  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 312 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1329  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 312 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.371543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3624  ABC transporter related  55.99 
 
 		 314 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2945  ABC transporter related  60.55 
 
 		 354 aa  322  4e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00675888  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3117  ABC transporter related  52.1 
 
 		 312 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0287879  normal  0.0491103 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0149  ABC transporter related  47.39 
 
 		 314 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4639  ABC transporter related  48.87 
 
 		 312 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.493735  normal  0.263146 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0297  ABC transporter related  48.54 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0143  ABC transporter related  47.39 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2380  ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.850605  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2137  ABC transporter related  47.71 
 
 		 312 aa  289  4e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1993  amine ABC transporter, ATP-binding protein  48.54 
 
 		 312 aa  288  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0239  amine ABC transporter, ATP-binding protein  48.54 
 
 		 312 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.46205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1140  ABC transporter, ATP-binding protein  48.54 
 
 		 312 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0408912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1580  amine ABC transporter, ATP-binding protein  48.54 
 
 		 312 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1974  amine ABC transporter, ATP-binding protein  48.54 
 
 		 312 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2132  ABC transporter, ATP-binding protein  48.54 
 
 		 312 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0920  amine ABC transporter, ATP-binding protein  48.54 
 
 		 312 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0223  ABC transporter, ATP-binding protein  48.22 
 
 		 312 aa  285  9e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0214  ABC transporter, ATP-binding protein  48.22 
 
 		 312 aa  285  9e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4537  ABC transporter related  49.83 
 
 		 312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5061  ABC transporter related  49.83 
 
 		 312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2530  ABC transporter related  51.54 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3511  ABC transporter related  48.82 
 
 		 312 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5139  ABC transporter related  49.16 
 
 		 317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0497  ABC proline/glycine betaine transporter, ATPase subunit  48.81 
 
 		 312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3224  ABC transporter related  49.16 
 
 		 317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5143  ABC transporter related  49.16 
 
 		 317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2475  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.61 
 
 		 408 aa  272  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00846223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2523  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.61 
 
 		 408 aa  272  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0108992  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0172  ABC transporter related  49.18 
 
 		 310 aa  273  4.0000000000000004e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1154  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  47.84 
 
 		 318 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  48.03 
 
 		 324 aa  269  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0985  ABC transporter related  47.1 
 
 		 321 aa  268  7e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.997708  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0577  ABC transporter related  47.1 
 
 		 334 aa  268  8.999999999999999e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000339076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2358  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.12 
 
 		 395 aa  265  8e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.46 
 
 		 375 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1276  ABC transporter related  50.76 
 
 		 321 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4756  ABC transporter related protein  43.91 
 
 		 328 aa  263  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1815  ABC transporter related  51.39 
 
 		 326 aa  261  6.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2031  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 		 418 aa  261  1e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.015462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2262  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1033  ABC transporter related protein  47.56 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2125  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 		 315 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2063  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 		 315 aa  259  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.832322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2279  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 		 315 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.987599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2305  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 		 315 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.264442 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2313  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 		 315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.499344  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2059  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 		 315 aa  258  6e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2389  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 		 315 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.301455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3063  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 		 315 aa  258  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1620  ABC transporter related  53.6 
 
 		 317 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00640  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  53.56 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.253633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.3 
 
 		 370 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2051  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.38 
 
 		 370 aa  256  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0478  ABC transporter related  53.56 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201964  hitchhiker  0.00297277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3565  ABC transporter related  47.02 
 
 		 333 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.230396 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2981  ABC transporter related  44.23 
 
 		 317 aa  255  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.53 
 
 		 379 aa  255  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 		 381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4888  ABC transporter related  50.2 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  hitchhiker  0.00773492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  49.8 
 
 		 392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0316  ABC transporter related protein  55.74 
 
 		 244 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37600  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  48.09 
 
 		 353 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.64 
 
 		 375 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0385  ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2557  ABC transporter related  54.81 
 
 		 362 aa  252  5.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000431635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18440  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.4 
 
 		 377 aa  252  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00065366  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5204  ABC transporter related protein  53.36 
 
 		 270 aa  251  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.213509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2099  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.99 
 
 		 321 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8181  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (proline/glycine/betaine)  44.81 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0762  ABC transporter related  48.52 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.128148  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0745  ABC transporter related  48.52 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2383  ABC transporter component  45.95 
 
 		 333 aa  250  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  50.4 
 
 		 376 aa  249  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2842  ABC transporter related  53.56 
 
 		 365 aa  249  6e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00414619  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15740  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  51.78 
 
 		 335 aa  248  8e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1848  choline transport ATP-binding protein opuBA  42.24 
 
 		 382 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4962  ABC transporter related  46.45 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0119  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.91 
 
 		 369 aa  246  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1126  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.88 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1921  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  41.91 
 
 		 382 aa  245  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>