More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1341 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1341  ABC transporter related protein  100 
 
 
373 aa  705    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.675912  hitchhiker  0.000979367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37600  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  56.46 
 
 
353 aa  358  7e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2668  ABC transporter related  55.71 
 
 
346 aa  330  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.194568  normal  0.0593639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4291  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  61.4 
 
 
351 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.603453 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4726  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  61.4 
 
 
364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.631244  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1033  ABC transporter related protein  60.56 
 
 
322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0622  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  61.87 
 
 
394 aa  302  6.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3109  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  57.69 
 
 
389 aa  298  9e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0577  ABC transporter related  55.56 
 
 
334 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000339076  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0985  ABC transporter related  55.56 
 
 
321 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.997708  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1081  ABC transporter related protein  63.14 
 
 
323 aa  296  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.136277  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26260  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  51.14 
 
 
384 aa  293  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.560056  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4151  ABC transporter related protein  57.6 
 
 
389 aa  294  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5105  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 
371 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.116998 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15740  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  58.8 
 
 
335 aa  291  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2913  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.49 
 
 
371 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.362905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2530  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.11 
 
 
391 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2493  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  54.11 
 
 
391 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2538  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.11 
 
 
391 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0404434  normal  0.847899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1635  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.96 
 
 
397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.839045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2051  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  55.56 
 
 
370 aa  288  9e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0452  ABC transporter related  60.85 
 
 
344 aa  287  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8181  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (proline/glycine/betaine)  58.47 
 
 
367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543085  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1622  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.15 
 
 
398 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00640  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  55 
 
 
386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.253633  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  53.16 
 
 
392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0546  ABC transporter related  63.57 
 
 
368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136652  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  56.35 
 
 
376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3265  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  56.86 
 
 
385 aa  280  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1154  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  55.82 
 
 
318 aa  278  8e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1620  ABC transporter related  60.24 
 
 
317 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1921  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.6 
 
 
382 aa  277  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2245  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  56.12 
 
 
370 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.4729  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0909  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  56.25 
 
 
335 aa  276  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0478  ABC transporter related  60.24 
 
 
333 aa  276  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201964  hitchhiker  0.00297277 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0172  ABC transporter related  57.98 
 
 
310 aa  276  5e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.7 
 
 
375 aa  275  9e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1555  ABC transporter related protein  51.85 
 
 
445 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2992  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  42.58 
 
 
400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1661  choline transport ATP-binding protein OpuBA  40.11 
 
 
382 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0868  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.9 
 
 
385 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1593  choline transport ATP-binding protein opuBA  40.11 
 
 
382 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.108629 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18440  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51 
 
 
377 aa  272  7e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00065366  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4886  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.32 
 
 
382 aa  272  7e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  0.719773 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1602  choline transport ATP-binding protein opuBA  40.11 
 
 
382 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.844336  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1681  choline transport ATP-binding protein opuBA  40.11 
 
 
382 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.413883  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0898  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.9 
 
 
385 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706016  normal  0.516388 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7553  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  53.11 
 
 
391 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4310  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.48 
 
 
385 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944105  normal  0.26992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1848  choline transport ATP-binding protein opuBA  49.6 
 
 
382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1290  ABC transporter related  55.27 
 
 
326 aa  269  5e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19367  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6584  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.7 
 
 
392 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00553818  normal  0.0117418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1406  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  56.85 
 
 
376 aa  269  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515015  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6102  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.7 
 
 
392 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.92 
 
 
370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0912  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.05 
 
 
385 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.195496 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0802  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  54.47 
 
 
398 aa  268  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6271  ABC transporter related  58.47 
 
 
360 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2354  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  47.64 
 
 
393 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2493  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  53.65 
 
 
388 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957361  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2981  ABC transporter related  53.41 
 
 
317 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
375 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0397  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  56.87 
 
 
369 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3636  ABC transporter related protein  58.13 
 
 
288 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.90014  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001530  L-proline Glycine Betaine ABC transport ATP-binding protein proV  41.53 
 
 
389 aa  264  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0119  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.41 
 
 
369 aa  263  4e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2945  ABC transporter related  50.87 
 
 
354 aa  263  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00675888  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0223  ABC transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 
312 aa  263  4.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0501  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (proline/glycine/betaine)  45.53 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0214  ABC transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 
312 aa  263  4.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3087  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 
435 aa  262  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0730099  normal  0.164806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1208  ABC transporter related  56.85 
 
 
369 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1276  ABC transporter related  52.79 
 
 
321 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2842  ABC transporter related  52.45 
 
 
365 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00414619  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1352  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
369 aa  260  3e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.739461  normal  0.456479 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1447  ABC transporter-related protein  56.45 
 
 
311 aa  260  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.908489  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4639  ABC transporter related  53.23 
 
 
312 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.493735  normal  0.263146 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2863  ABC transporter related  54.37 
 
 
312 aa  259  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.466149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1329  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  54.37 
 
 
312 aa  259  7e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.371543  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2784  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  54.37 
 
 
312 aa  259  8e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0803  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  51.48 
 
 
386 aa  258  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0426806  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4575  glycine betaine/choline OpuC ABC transporter, ATP-binding protein  51.9 
 
 
385 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449322  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30040  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  54.3 
 
 
282 aa  258  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0297  ABC transporter related  52.78 
 
 
312 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5600  ABC transporter-related protein  56.05 
 
 
370 aa  256  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763793  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  48.61 
 
 
324 aa  256  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1126  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 
367 aa  256  5e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4249  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  51.48 
 
 
388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4553  ABC transporter related protein  53.75 
 
 
364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2557  ABC transporter related  53.63 
 
 
362 aa  253  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000431635 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4756  ABC transporter related protein  50.4 
 
 
328 aa  253  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.36 
 
 
379 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5204  ABC transporter related protein  55.04 
 
 
270 aa  253  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.213509  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0149  ABC transporter related  49.62 
 
 
314 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2728  ABC transporter related  51.91 
 
 
316 aa  251  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13790  osmoprotectant (glycine betaine/carnitine/choline/L-proline) transport system ATP-binding protein proV  56.05 
 
 
376 aa  250  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5347  ABC transporter related  54.44 
 
 
369 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343425  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4966  ABC transporter related  54.44 
 
 
369 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5054  ABC transporter related  54.44 
 
 
369 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.763811  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0771  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.85 
 
 
380 aa  249  6e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>