More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1276 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1276  ABC transporter related  100 
 
 
321 aa  656    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4962  ABC transporter related  52.84 
 
 
328 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  55.56 
 
 
375 aa  291  8e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18440  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  55.37 
 
 
377 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00065366  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1352  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.82 
 
 
369 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.739461  normal  0.456479 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1329  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  51.01 
 
 
312 aa  280  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.371543  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2784  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  51.01 
 
 
312 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.16 
 
 
375 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2863  ABC transporter related  51.01 
 
 
312 aa  280  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.466149  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0316  ABC transporter related protein  56.38 
 
 
244 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  52.55 
 
 
392 aa  278  7e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0577  ABC transporter related  54.3 
 
 
334 aa  278  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000339076  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0985  ABC transporter related  54.3 
 
 
321 aa  278  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.997708  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1249  ABC transporter related  57.2 
 
 
253 aa  276  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.540719  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15740  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  54.43 
 
 
335 aa  275  6e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0223  ABC transporter, ATP-binding protein  49.66 
 
 
312 aa  275  8e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  52.4 
 
 
376 aa  275  8e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0214  ABC transporter, ATP-binding protein  49.66 
 
 
312 aa  275  8e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2728  ABC transporter related  52.49 
 
 
316 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1447  ABC transporter-related protein  57.32 
 
 
311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.908489  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2945  ABC transporter related  55.1 
 
 
354 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00675888  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00640  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  52.19 
 
 
386 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.253633  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.79 
 
 
370 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5204  ABC transporter related protein  53.85 
 
 
270 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.213509  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5105  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.78 
 
 
371 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.116998 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2262  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  46.33 
 
 
315 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4151  ABC transporter related protein  50.2 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1922  glycine betaine transport ATP-binding protein  54.07 
 
 
252 aa  270  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2530  ABC transporter related  48.44 
 
 
326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0268  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  54.07 
 
 
252 aa  270  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2354  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  43.45 
 
 
393 aa  269  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3063  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  46 
 
 
315 aa  269  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.37 
 
 
379 aa  269  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0172  ABC transporter related  54.81 
 
 
310 aa  269  5.9999999999999995e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0909  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  53.33 
 
 
335 aa  268  7e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2313  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 
315 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.499344  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2125  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  46 
 
 
315 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2063  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  46 
 
 
315 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.832322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2279  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  46 
 
 
315 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.987599  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3334  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.21 
 
 
376 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0347475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2305  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  46 
 
 
315 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.264442 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1555  ABC transporter related protein  48.24 
 
 
445 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2059  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 
315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2913  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.02 
 
 
371 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.362905 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1593  choline transport ATP-binding protein opuBA  51.16 
 
 
382 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.108629 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1602  choline transport ATP-binding protein opuBA  51.16 
 
 
382 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.844336  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1681  choline transport ATP-binding protein opuBA  51.16 
 
 
382 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.413883  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1848  choline transport ATP-binding protein opuBA  51.16 
 
 
382 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02059  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  51.34 
 
 
308 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02017  hypothetical protein  51.34 
 
 
308 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4310  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.24 
 
 
385 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944105  normal  0.26992 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1661  choline transport ATP-binding protein OpuBA  51.16 
 
 
382 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1921  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
382 aa  266  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001530  L-proline Glycine Betaine ABC transport ATP-binding protein proV  43.89 
 
 
389 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2389  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  45.67 
 
 
315 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.301455  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0297  ABC transporter related  48.12 
 
 
312 aa  265  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0868  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.24 
 
 
385 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0898  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.24 
 
 
385 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706016  normal  0.516388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0912  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.24 
 
 
385 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.195496 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0844  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  50.76 
 
 
308 aa  265  8.999999999999999e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0915  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  50.76 
 
 
308 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.530478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1518  ABC transporter related  50.76 
 
 
308 aa  264  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2418  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  50.76 
 
 
308 aa  264  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1528  ABC transporter related protein  50.96 
 
 
308 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.917455  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4291  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  53.88 
 
 
351 aa  263  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.603453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2397  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  51.75 
 
 
315 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3254  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  50.38 
 
 
308 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2264  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  50.96 
 
 
308 aa  263  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2509  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  51.75 
 
 
315 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2401  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  51.75 
 
 
315 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2308  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  51.75 
 
 
315 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7553  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  51.64 
 
 
391 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2352  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  51.75 
 
 
315 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1033  ABC transporter related protein  51.82 
 
 
322 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1154  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  51.24 
 
 
318 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0521  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein  48.63 
 
 
378 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.691197  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1856  ABC transporter related  44.22 
 
 
310 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.500244  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2992  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  52.05 
 
 
400 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0537  glycine betaine/L-proline transport, ATP-binding protein  48.24 
 
 
378 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2475  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.65 
 
 
408 aa  261  8e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00846223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2523  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.65 
 
 
408 aa  261  8e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0108992  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37600  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  52.72 
 
 
353 aa  261  8.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2099  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.33 
 
 
321 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3511  ABC transporter related  45.25 
 
 
312 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4886  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.42 
 
 
382 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  0.719773 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4537  ABC transporter related  44.59 
 
 
312 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67365  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4726  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.15 
 
 
364 aa  260  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.631244  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6584  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.23 
 
 
392 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00553818  normal  0.0117418 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6102  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.23 
 
 
392 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2981  ABC transporter related  51.24 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5061  ABC transporter related  44.59 
 
 
312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2245  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.91 
 
 
370 aa  259  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.4729  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2530  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.59 
 
 
391 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2493  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  50.59 
 
 
391 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2538  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.59 
 
 
391 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0404434  normal  0.847899 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4756  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
328 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1815  ABC transporter related  52.55 
 
 
326 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1126  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.47 
 
 
367 aa  258  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2051  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.26 
 
 
370 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0762  ABC transporter related  49.21 
 
 
325 aa  257  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.128148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>