More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1329 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1329  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
312 aa  634    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.371543  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2863  ABC transporter related  100 
 
 
312 aa  634    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.466149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2784  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  99.68 
 
 
312 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1447  ABC transporter-related protein  77.67 
 
 
311 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.908489  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1856  ABC transporter related  69.93 
 
 
310 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.500244  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2728  ABC transporter related  67.1 
 
 
316 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2401  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  67.75 
 
 
315 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2397  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  67.75 
 
 
315 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2308  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  67.75 
 
 
315 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2509  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  67.75 
 
 
315 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2352  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  67.75 
 
 
315 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02059  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  66.99 
 
 
308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1528  ABC transporter related protein  66.67 
 
 
308 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.917455  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0844  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  66.67 
 
 
308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2418  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 
308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02017  hypothetical protein  66.99 
 
 
308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2264  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 
308 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1518  ABC transporter related  66.67 
 
 
308 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3254  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  66.34 
 
 
308 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0915  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  66.34 
 
 
308 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.530478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3624  ABC transporter related  60.66 
 
 
314 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2945  ABC transporter related  61.09 
 
 
354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00675888  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3117  ABC transporter related  55.84 
 
 
312 aa  326  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0287879  normal  0.0491103 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2137  ABC transporter related  49.36 
 
 
312 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3511  ABC transporter related  52.03 
 
 
312 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0223  ABC transporter, ATP-binding protein  50.16 
 
 
312 aa  297  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0214  ABC transporter, ATP-binding protein  50.16 
 
 
312 aa  297  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4537  ABC transporter related  50.85 
 
 
312 aa  295  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67365  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4639  ABC transporter related  49.52 
 
 
312 aa  295  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.493735  normal  0.263146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5061  ABC transporter related  50.85 
 
 
312 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5139  ABC transporter related  50.84 
 
 
317 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192374  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3224  ABC transporter related  50.84 
 
 
317 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5143  ABC transporter related  50.84 
 
 
317 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310364  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0149  ABC transporter related  48.04 
 
 
314 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1276  ABC transporter related  51.01 
 
 
321 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0143  ABC transporter related  48.04 
 
 
314 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1993  amine ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 
312 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0497  ABC proline/glycine betaine transporter, ATPase subunit  51.56 
 
 
312 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975936  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0297  ABC transporter related  48.87 
 
 
312 aa  289  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  49.04 
 
 
376 aa  289  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4291  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.63 
 
 
351 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.603453 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.48 
 
 
379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1140  ABC transporter, ATP-binding protein  48.23 
 
 
312 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0408912  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1974  amine ABC transporter, ATP-binding protein  48.23 
 
 
312 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2132  ABC transporter, ATP-binding protein  48.23 
 
 
312 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314823  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1580  amine ABC transporter, ATP-binding protein  48.23 
 
 
312 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0239  amine ABC transporter, ATP-binding protein  48.23 
 
 
312 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.46205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0920  amine ABC transporter, ATP-binding protein  48.23 
 
 
312 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2380  ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 
312 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.850605  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  47.74 
 
 
324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4962  ABC transporter related  56.1 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.84 
 
 
375 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 
370 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2475  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.75 
 
 
408 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00846223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2523  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.75 
 
 
408 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0108992  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37600  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  49.22 
 
 
353 aa  278  7e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1154  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  47.84 
 
 
318 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2031  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 
418 aa  276  3e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.015462  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2313  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  47.85 
 
 
315 aa  276  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.499344  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4726  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.48 
 
 
364 aa  276  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.631244  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0577  ABC transporter related  49.68 
 
 
334 aa  276  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000339076  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0985  ABC transporter related  49.68 
 
 
321 aa  275  5e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.997708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18440  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.15 
 
 
377 aa  275  8e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00065366  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2059  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  47.85 
 
 
315 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2358  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 
395 aa  271  7e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  53.36 
 
 
392 aa  272  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2125  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  47.85 
 
 
315 aa  271  7e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2063  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  47.85 
 
 
315 aa  271  7e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.832322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2305  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  47.85 
 
 
315 aa  271  7e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.264442 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2279  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  47.85 
 
 
315 aa  271  7e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.987599  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00640  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  54.94 
 
 
386 aa  271  7e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.253633  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1661  choline transport ATP-binding protein OpuBA  45.78 
 
 
382 aa  271  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1681  choline transport ATP-binding protein opuBA  45.78 
 
 
382 aa  271  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.413883  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1602  choline transport ATP-binding protein opuBA  45.78 
 
 
382 aa  271  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.844336  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1593  choline transport ATP-binding protein opuBA  45.78 
 
 
382 aa  271  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.108629 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2389  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  47.85 
 
 
315 aa  271  9e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.301455  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1921  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 
382 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2530  ABC transporter related  50 
 
 
326 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.95 
 
 
375 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1033  ABC transporter related protein  50.49 
 
 
322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0172  ABC transporter related  47.92 
 
 
310 aa  269  4e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1848  choline transport ATP-binding protein opuBA  45.45 
 
 
382 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2099  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.85 
 
 
321 aa  269  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2262  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 
315 aa  267  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2051  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.72 
 
 
370 aa  267  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4756  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
328 aa  267  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2981  ABC transporter related  46.69 
 
 
317 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3063  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 
315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4151  ABC transporter related protein  52.55 
 
 
389 aa  265  5.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1922  glycine betaine transport ATP-binding protein  54.7 
 
 
252 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3565  ABC transporter related  48.96 
 
 
333 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.230396 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0521  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein  42.59 
 
 
378 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.691197  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0268  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  54.7 
 
 
252 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1352  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.24 
 
 
369 aa  263  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.739461  normal  0.456479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8181  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (proline/glycine/betaine)  49.03 
 
 
367 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543085  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15740  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  47.63 
 
 
335 aa  263  3e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0537  glycine betaine/L-proline transport, ATP-binding protein  42.27 
 
 
378 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1249  ABC transporter related  50.58 
 
 
253 aa  262  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.540719  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0771  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.95 
 
 
380 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1341  ABC transporter related protein  54.37 
 
 
373 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.675912  hitchhiker  0.000979367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>