More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2401 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2352  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  99.68 
 
 		 315 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2509  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  100 
 
 		 315 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2308  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  100 
 
 		 315 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2401  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  100 
 
 		 315 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2397  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  99.68 
 
 		 315 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2264  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  87.34 
 
 		 308 aa  551  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1518  ABC transporter related  87.34 
 
 		 308 aa  551  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0915  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  87.66 
 
 		 308 aa  552  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.530478 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2418  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  87.34 
 
 		 308 aa  551  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02059  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  87.01 
 
 		 308 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1528  ABC transporter related protein  87.34 
 
 		 308 aa  550  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.917455  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0844  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  87.01 
 
 		 308 aa  547  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02017  hypothetical protein  87.01 
 
 		 308 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3254  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  86.69 
 
 		 308 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625793 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2728  ABC transporter related  79.48 
 
 		 316 aa  502  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1447  ABC transporter-related protein  67.1 
 
 		 311 aa  404  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.908489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2863  ABC transporter related  67.75 
 
 		 312 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.466149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2784  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  67.75 
 
 		 312 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1329  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  67.75 
 
 		 312 aa  402  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.371543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1856  ABC transporter related  62.09 
 
 		 310 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.500244  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3624  ABC transporter related  54.78 
 
 		 314 aa  340  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2945  ABC transporter related  60.55 
 
 		 354 aa  319  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00675888  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3117  ABC transporter related  50.8 
 
 		 312 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0287879  normal  0.0491103 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2137  ABC transporter related  48.4 
 
 		 312 aa  297  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4639  ABC transporter related  48.24 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.493735  normal  0.263146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0149  ABC transporter related  47.39 
 
 		 314 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2380  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 312 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.850605  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0239  amine ABC transporter, ATP-binding protein  49.66 
 
 		 312 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.46205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1140  ABC transporter, ATP-binding protein  49.66 
 
 		 312 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0408912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1580  amine ABC transporter, ATP-binding protein  49.66 
 
 		 312 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1974  amine ABC transporter, ATP-binding protein  49.66 
 
 		 312 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2132  ABC transporter, ATP-binding protein  49.66 
 
 		 312 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0920  amine ABC transporter, ATP-binding protein  49.66 
 
 		 312 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1993  amine ABC transporter, ATP-binding protein  49.66 
 
 		 312 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0143  ABC transporter related  46.73 
 
 		 314 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5061  ABC transporter related  49.66 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4537  ABC transporter related  49.66 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0297  ABC transporter related  47.9 
 
 		 312 aa  278  8e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3511  ABC transporter related  49.16 
 
 		 312 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0223  ABC transporter, ATP-binding protein  47.57 
 
 		 312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0214  ABC transporter, ATP-binding protein  47.57 
 
 		 312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2530  ABC transporter related  50.5 
 
 		 326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0577  ABC transporter related  48.06 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000339076  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0985  ABC transporter related  48.06 
 
 		 321 aa  273  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.997708  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5139  ABC transporter related  49.48 
 
 		 317 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1154  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  47.84 
 
 		 318 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0172  ABC transporter related  49.2 
 
 		 310 aa  272  6e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3224  ABC transporter related  49.13 
 
 		 317 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5143  ABC transporter related  49.13 
 
 		 317 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0497  ABC proline/glycine betaine transporter, ATPase subunit  48.64 
 
 		 312 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4756  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4888  ABC transporter related  48.45 
 
 		 310 aa  269  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  hitchhiker  0.00773492 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  48.2 
 
 		 324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18440  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 377 aa  264  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00065366  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2358  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.95 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00640  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  54.81 
 
 		 386 aa  263  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.253633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2262  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  44.52 
 
 		 315 aa  263  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3063  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  44.52 
 
 		 315 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1276  ABC transporter related  51.75 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2313  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 		 315 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.499344  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.81 
 
 		 375 aa  262  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.54 
 
 		 379 aa  261  8e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2475  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.3 
 
 		 408 aa  261  8.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00846223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2523  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.3 
 
 		 408 aa  261  8.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0108992  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2389  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.301455  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2031  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 		 418 aa  260  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.015462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 		 370 aa  260  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2125  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  43.55 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2063  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.832322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2279  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  43.55 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.987599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2305  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.264442 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2059  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 315 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.02 
 
 		 381 aa  259  4e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  44.55 
 
 		 376 aa  258  9e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5204  ABC transporter related protein  53.78 
 
 		 270 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.213509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2051  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.17 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0119  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.47 
 
 		 369 aa  256  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1815  ABC transporter related  54 
 
 		 326 aa  255  6e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  41.83 
 
 		 375 aa  255  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1033  ABC transporter related protein  53.01 
 
 		 322 aa  255  9e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2099  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.58 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2557  ABC transporter related  54.81 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000431635 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3334  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.47 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0347475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0745  ABC transporter related  48.52 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0762  ABC transporter related  48.52 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.128148  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0316  ABC transporter related protein  54.89 
 
 		 244 aa  253  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0622  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.18 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2981  ABC transporter related  42.99 
 
 		 317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2842  ABC transporter related  51.92 
 
 		 365 aa  252  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00414619  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3565  ABC transporter related  47.87 
 
 		 333 aa  251  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.230396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  49.02 
 
 		 392 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4962  ABC transporter related  50.79 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37600  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  46.5 
 
 		 353 aa  250  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1620  ABC transporter related  52.4 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6271  ABC transporter related  52.96 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15740  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  52.96 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0478  ABC transporter related  53.14 
 
 		 333 aa  249  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201964  hitchhiker  0.00297277 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0771  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.22 
 
 		 380 aa  248  7e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0909  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.31 
 
 		 335 aa  248  9e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0385  ABC transporter, ATP-binding protein  48.95 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>