More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5143 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5139  ABC transporter related  99.68 
 
 
317 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192374  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3224  ABC transporter related  100 
 
 
317 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5143  ABC transporter related  100 
 
 
317 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310364  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0497  ABC proline/glycine betaine transporter, ATPase subunit  91.17 
 
 
312 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975936  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5061  ABC transporter related  89.91 
 
 
312 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4537  ABC transporter related  89.91 
 
 
312 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67365  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3511  ABC transporter related  87.38 
 
 
312 aa  529  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1993  amine ABC transporter, ATP-binding protein  77.6 
 
 
312 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0920  amine ABC transporter, ATP-binding protein  77.29 
 
 
312 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0239  amine ABC transporter, ATP-binding protein  77.29 
 
 
312 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.46205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1140  ABC transporter, ATP-binding protein  77.29 
 
 
312 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0408912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2132  ABC transporter, ATP-binding protein  77.29 
 
 
312 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1974  amine ABC transporter, ATP-binding protein  77.29 
 
 
312 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1580  amine ABC transporter, ATP-binding protein  77.29 
 
 
312 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2380  ABC transporter, ATP-binding protein  77.29 
 
 
312 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.850605  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4639  ABC transporter related  58.23 
 
 
312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.493735  normal  0.263146 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0214  ABC transporter, ATP-binding protein  58.68 
 
 
312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0223  ABC transporter, ATP-binding protein  58.68 
 
 
312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0297  ABC transporter related  57.73 
 
 
312 aa  344  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0149  ABC transporter related  58.76 
 
 
314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0143  ABC transporter related  57.73 
 
 
314 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2383  ABC transporter component  60.19 
 
 
333 aa  332  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4888  ABC transporter related  59.52 
 
 
310 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  hitchhiker  0.00773492 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3117  ABC transporter related  56.12 
 
 
312 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0287879  normal  0.0491103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02059  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  50.52 
 
 
308 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02017  hypothetical protein  50.52 
 
 
308 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1856  ABC transporter related  49.48 
 
 
310 aa  276  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.500244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1329  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  50.84 
 
 
312 aa  276  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.371543  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2863  ABC transporter related  50.84 
 
 
312 aa  276  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.466149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2784  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  50.84 
 
 
312 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5204  ABC transporter related protein  56.72 
 
 
270 aa  275  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.213509  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1518  ABC transporter related  49.49 
 
 
308 aa  275  6e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0844  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  49.33 
 
 
308 aa  275  7e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1528  ABC transporter related protein  50.17 
 
 
308 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.917455  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3254  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  48.99 
 
 
308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0915  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  49.49 
 
 
308 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.530478 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2264  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  50.17 
 
 
308 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2418  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  49.16 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1447  ABC transporter-related protein  51.39 
 
 
311 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.908489  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1154  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  47.8 
 
 
318 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4291  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.9 
 
 
351 aa  272  6e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.603453 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2945  ABC transporter related  52.04 
 
 
354 aa  271  8.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00675888  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2401  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  49.13 
 
 
315 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2352  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  49.13 
 
 
315 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2308  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  49.13 
 
 
315 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2509  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  49.13 
 
 
315 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2397  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  49.13 
 
 
315 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0172  ABC transporter related  53.63 
 
 
310 aa  271  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4151  ABC transporter related protein  51.74 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4726  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  53.48 
 
 
364 aa  268  8.999999999999999e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.631244  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2981  ABC transporter related  48.68 
 
 
317 aa  267  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3624  ABC transporter related  48.3 
 
 
314 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2051  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  56 
 
 
370 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.14 
 
 
375 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18440  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.15 
 
 
377 aa  260  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00065366  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4756  ABC transporter related protein  45.28 
 
 
328 aa  260  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  47.89 
 
 
324 aa  260  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2728  ABC transporter related  46.31 
 
 
316 aa  258  8e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0478  ABC transporter related  54.62 
 
 
333 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201964  hitchhiker  0.00297277 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.75 
 
 
370 aa  257  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2475  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.28 
 
 
408 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00846223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2523  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.28 
 
 
408 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0108992  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 
381 aa  255  7e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1620  ABC transporter related  55.95 
 
 
317 aa  255  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.44 
 
 
375 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0577  ABC transporter related  48.09 
 
 
334 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000339076  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0985  ABC transporter related  48.09 
 
 
321 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.997708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0452  ABC transporter related  55.12 
 
 
344 aa  253  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1921  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.94 
 
 
382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3336  ABC transporter related  56.69 
 
 
264 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.314642  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1352  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.04 
 
 
369 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.739461  normal  0.456479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0912  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
385 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.195496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0868  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.62 
 
 
385 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0898  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.62 
 
 
385 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706016  normal  0.516388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2842  ABC transporter related  53.12 
 
 
365 aa  249  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00414619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.39 
 
 
379 aa  249  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  45.4 
 
 
376 aa  249  6e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0397  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.86 
 
 
369 aa  248  8e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1033  ABC transporter related protein  50.35 
 
 
322 aa  248  9e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1555  ABC transporter related protein  54.2 
 
 
445 aa  247  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0802  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  51.78 
 
 
398 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3265  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  53.78 
 
 
385 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0316  ABC transporter related protein  53.06 
 
 
244 aa  247  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1681  choline transport ATP-binding protein opuBA  51.78 
 
 
382 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.413883  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2530  ABC transporter related  47.55 
 
 
326 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1593  choline transport ATP-binding protein opuBA  51.78 
 
 
382 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.108629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4310  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.85 
 
 
385 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944105  normal  0.26992 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1661  choline transport ATP-binding protein OpuBA  51.78 
 
 
382 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1848  choline transport ATP-binding protein opuBA  51.78 
 
 
382 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1602  choline transport ATP-binding protein opuBA  51.78 
 
 
382 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.844336  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0537  glycine betaine/L-proline transport, ATP-binding protein  48.76 
 
 
378 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418471  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0521  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein  48.76 
 
 
378 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.691197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8181  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (proline/glycine/betaine)  54 
 
 
367 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543085  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2493  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  51.38 
 
 
388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957361  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  51.78 
 
 
392 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1276  ABC transporter related  45.14 
 
 
321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4962  ABC transporter related  48.52 
 
 
328 aa  245  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2992  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  50.59 
 
 
400 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0268  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  51.26 
 
 
252 aa  245  9e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1922  glycine betaine transport ATP-binding protein  51.26 
 
 
252 aa  245  9e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>