More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0244 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
381 aa  776    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2523  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.55 
 
 
408 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0108992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2475  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.55 
 
 
408 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00846223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2358  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.5 
 
 
395 aa  421  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2031  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.99 
 
 
418 aa  414  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.015462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  48.53 
 
 
376 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.3 
 
 
370 aa  331  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.53 
 
 
375 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.51 
 
 
375 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0537  glycine betaine/L-proline transport, ATP-binding protein  45.65 
 
 
378 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418471  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0521  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein  45.38 
 
 
378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.691197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.27 
 
 
379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3334  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  41.8 
 
 
376 aa  296  5e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0347475  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1516  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.74 
 
 
383 aa  294  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000189074  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0118  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  41.88 
 
 
378 aa  289  6e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.435278  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4310  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  39.95 
 
 
385 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944105  normal  0.26992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2137  ABC transporter related  44.59 
 
 
312 aa  276  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0802  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  41.81 
 
 
398 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2493  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  41.11 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957361  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0868  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  39.68 
 
 
385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0898  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  39.68 
 
 
385 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706016  normal  0.516388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0912  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  39.41 
 
 
385 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.195496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2992  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  40.11 
 
 
400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5105  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  40.22 
 
 
371 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.116998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4575  glycine betaine/choline OpuC ABC transporter, ATP-binding protein  40.75 
 
 
385 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4249  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  40.75 
 
 
388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0803  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  41.02 
 
 
386 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0426806  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3511  ABC transporter related  45.02 
 
 
312 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2913  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  38.32 
 
 
371 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.362905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3117  ABC transporter related  43.61 
 
 
312 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0287879  normal  0.0491103 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1921  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  36.94 
 
 
382 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5061  ABC transporter related  44.05 
 
 
312 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1154  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  43.27 
 
 
318 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  41.61 
 
 
324 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0172  ABC transporter related  42.07 
 
 
310 aa  264  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4537  ABC transporter related  43.73 
 
 
312 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67365  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1856  ABC transporter related  42.95 
 
 
310 aa  262  8e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.500244  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1602  choline transport ATP-binding protein opuBA  38.87 
 
 
382 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.844336  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1681  choline transport ATP-binding protein opuBA  38.87 
 
 
382 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.413883  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0909  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 
335 aa  261  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1593  choline transport ATP-binding protein opuBA  38.87 
 
 
382 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.108629 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2313  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 
315 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.499344  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1661  choline transport ATP-binding protein OpuBA  38.87 
 
 
382 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1848  choline transport ATP-binding protein opuBA  39.22 
 
 
382 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0771  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  38.9 
 
 
380 aa  260  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2308  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  42.02 
 
 
315 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2509  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  42.02 
 
 
315 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7553  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  38.77 
 
 
391 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2401  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  42.02 
 
 
315 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2352  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  42.02 
 
 
315 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0214  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 
312 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2397  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  42.02 
 
 
315 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0223  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 
312 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3624  ABC transporter related  45.02 
 
 
314 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2354  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  38.38 
 
 
393 aa  257  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6584  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  38.5 
 
 
392 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00553818  normal  0.0117418 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4639  ABC transporter related  43.17 
 
 
312 aa  257  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.493735  normal  0.263146 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2728  ABC transporter related  48.75 
 
 
316 aa  257  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13580  ABC transporter ATP-binding protein  39.84 
 
 
387 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6102  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  38.24 
 
 
392 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0083  ABC transporter related  48.37 
 
 
255 aa  256  6e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001530  L-proline Glycine Betaine ABC transport ATP-binding protein proV  39.57 
 
 
389 aa  256  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3224  ABC transporter related  44.86 
 
 
317 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5143  ABC transporter related  44.86 
 
 
317 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310364  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1528  ABC transporter related protein  41.78 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.917455  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5139  ABC transporter related  44.86 
 
 
317 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192374  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1352  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  39.24 
 
 
369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.739461  normal  0.456479 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2389  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  43.37 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.301455  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2264  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  41.78 
 
 
308 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3254  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  42.11 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0915  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  41.78 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.530478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02059  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  41.78 
 
 
308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1518  ABC transporter related  41.78 
 
 
308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02017  hypothetical protein  41.78 
 
 
308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2418  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  41.78 
 
 
308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1215  ABC transporter ATP-binding protein  39.57 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0844  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  41.78 
 
 
308 aa  254  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2059  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  43.37 
 
 
315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3063  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  43.37 
 
 
315 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0577  ABC transporter related  42.58 
 
 
334 aa  253  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000339076  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4886  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  38.86 
 
 
382 aa  252  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  0.719773 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4756  ABC transporter related protein  41.03 
 
 
328 aa  251  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0497  ABC proline/glycine betaine transporter, ATPase subunit  43.09 
 
 
312 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975936  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0985  ABC transporter related  42.58 
 
 
321 aa  252  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.997708  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2981  ABC transporter related  42.9 
 
 
317 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4291  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.81 
 
 
351 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.603453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6271  ABC transporter related  48.96 
 
 
360 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2945  ABC transporter related  46.15 
 
 
354 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00675888  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0297  ABC transporter related  43.95 
 
 
312 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2784  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  42.35 
 
 
312 aa  250  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2262  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  43.37 
 
 
315 aa  249  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  51.25 
 
 
392 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2125  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  42.72 
 
 
315 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2063  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 
315 aa  249  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.832322  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18440  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  40.11 
 
 
377 aa  249  7e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00065366  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2279  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  42.72 
 
 
315 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.987599  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0546  ABC transporter related  37.46 
 
 
368 aa  249  7e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136652  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2305  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 
315 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.264442 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2863  ABC transporter related  42.35 
 
 
312 aa  249  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.466149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1329  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  42.35 
 
 
312 aa  249  8e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.371543  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>