More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1922 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1922  glycine betaine transport ATP-binding protein  100 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0268  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  55.27 
 
 
324 aa  281  8.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  55.88 
 
 
370 aa  277  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5204  ABC transporter related protein  53.33 
 
 
270 aa  275  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.213509  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  55.88 
 
 
376 aa  271  7e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1154  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  53.33 
 
 
318 aa  271  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2313  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  54.2 
 
 
315 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.499344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1276  ABC transporter related  54.07 
 
 
321 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2354  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  53.72 
 
 
393 aa  268  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2389  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  54.2 
 
 
315 aa  267  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.301455  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2530  ABC transporter related  55.04 
 
 
326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2125  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  53.36 
 
 
315 aa  265  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2063  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 
315 aa  265  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.832322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2059  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 
315 aa  265  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2305  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 
315 aa  265  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.264442 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2279  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  53.36 
 
 
315 aa  265  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.987599  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5105  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.58 
 
 
371 aa  263  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.116998 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1602  choline transport ATP-binding protein opuBA  53.5 
 
 
382 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.844336  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4151  ABC transporter related protein  52.94 
 
 
389 aa  263  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1681  choline transport ATP-binding protein opuBA  53.5 
 
 
382 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.413883  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1848  choline transport ATP-binding protein opuBA  53.5 
 
 
382 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2262  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 
315 aa  263  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  54.2 
 
 
379 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1661  choline transport ATP-binding protein OpuBA  53.5 
 
 
382 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3063  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
315 aa  262  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001530  L-proline Glycine Betaine ABC transport ATP-binding protein proV  53.75 
 
 
389 aa  263  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1921  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.26 
 
 
382 aa  262  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1593  choline transport ATP-binding protein opuBA  53.5 
 
 
382 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.108629 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0909  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  53.33 
 
 
335 aa  261  4.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2099  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.94 
 
 
321 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2523  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.5 
 
 
408 aa  260  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0108992  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18440  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.94 
 
 
377 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00065366  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2475  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.5 
 
 
408 aa  260  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00846223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  53.75 
 
 
392 aa  259  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2493  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  53.94 
 
 
388 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957361  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4886  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.92 
 
 
382 aa  259  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  0.719773 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.94 
 
 
375 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2913  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.92 
 
 
371 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.362905 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7553  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  52.65 
 
 
391 aa  258  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0577  ABC transporter related  54.39 
 
 
334 aa  258  7e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000339076  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1635  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.46 
 
 
397 aa  258  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.839045 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1815  ABC transporter related  55.7 
 
 
326 aa  258  9e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00640  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  52.94 
 
 
386 aa  257  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.253633  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2992  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  53.06 
 
 
400 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2493  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  53.72 
 
 
391 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167851  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0985  ABC transporter related  54.39 
 
 
321 aa  257  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.997708  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2538  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  53.72 
 
 
391 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0404434  normal  0.847899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2530  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  53.72 
 
 
391 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2051  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  53.31 
 
 
370 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6584  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.65 
 
 
392 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00553818  normal  0.0117418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3109  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  53.31 
 
 
389 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6102  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.65 
 
 
392 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4291  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  53.78 
 
 
351 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.603453 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0802  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  52.28 
 
 
398 aa  254  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4962  ABC transporter related  53.85 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_004310  BR0223  ABC transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 
312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0214  ABC transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 
312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3511  ABC transporter related  53.56 
 
 
312 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0118  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.1 
 
 
378 aa  253  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.435278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1622  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.64 
 
 
398 aa  251  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2245  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.52 
 
 
370 aa  251  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.4729  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5061  ABC transporter related  52.94 
 
 
312 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4537  ABC transporter related  52.52 
 
 
312 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67365  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2031  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.92 
 
 
418 aa  250  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.015462  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1352  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.65 
 
 
369 aa  250  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.739461  normal  0.456479 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  53.39 
 
 
375 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2358  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 
395 aa  250  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3565  ABC transporter related  54.09 
 
 
333 aa  249  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.230396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4726  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  52.94 
 
 
364 aa  248  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.631244  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1329  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  54.7 
 
 
312 aa  248  6e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.371543  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2863  ABC transporter related  54.7 
 
 
312 aa  248  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.466149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2784  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  54.7 
 
 
312 aa  248  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0186  ABC transporter related  53.6 
 
 
256 aa  248  9e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0868  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.64 
 
 
385 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0898  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.64 
 
 
385 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706016  normal  0.516388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3117  ABC transporter related  49.58 
 
 
312 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0287879  normal  0.0491103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4310  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.64 
 
 
385 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944105  normal  0.26992 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1993  amine ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
312 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0297  ABC transporter related  52.52 
 
 
312 aa  245  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0497  ABC proline/glycine betaine transporter, ATPase subunit  51.68 
 
 
312 aa  245  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975936  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0912  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.64 
 
 
385 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.195496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1033  ABC transporter related protein  51.68 
 
 
322 aa  245  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15740  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  50.41 
 
 
335 aa  245  4.9999999999999997e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4639  ABC transporter related  52.1 
 
 
312 aa  244  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.493735  normal  0.263146 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5139  ABC transporter related  51.26 
 
 
317 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192374  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3224  ABC transporter related  51.26 
 
 
317 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5143  ABC transporter related  51.26 
 
 
317 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310364  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0119  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.16 
 
 
369 aa  244  8e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0478  ABC transporter related  47.06 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201964  hitchhiker  0.00297277 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1555  ABC transporter related protein  47.67 
 
 
445 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0397  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  53.97 
 
 
369 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0316  ABC transporter related protein  52.23 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1620  ABC transporter related  48.32 
 
 
317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0452  ABC transporter related  52.72 
 
 
344 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2252  ABC transporter related  49.19 
 
 
257 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411417  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1140  ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 
312 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0408912  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0920  amine ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 
312 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1580  amine ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 
312 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0239  amine ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 
312 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.46205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>