More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1124 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1124  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 395 aa  798    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  43.88 
 
 		 379 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  43.88 
 
 		 379 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  43.88 
 
 		 379 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  43.88 
 
 		 379 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  44.44 
 
 		 383 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  44.85 
 
 		 376 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  43.62 
 
 		 379 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  43.94 
 
 		 383 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  43.37 
 
 		 379 aa  286  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  45.12 
 
 		 374 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  45.19 
 
 		 379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  46.81 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  47.57 
 
 		 380 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  43.94 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  47.57 
 
 		 380 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  45.18 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  43.91 
 
 		 381 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  44.13 
 
 		 375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  43.62 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  43.54 
 
 		 381 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  43.65 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  43.37 
 
 		 375 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  43.37 
 
 		 375 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  41.69 
 
 		 383 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  40.92 
 
 		 383 aa  262  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  41.6 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  39 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  39 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  39.8 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  39.69 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1988  outer membrane porin  40.96 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1125  outer membrane porin OpcP, putative  40.69 
 
 		 407 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.61922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1567  putative outer membrane porin  40.69 
 
 		 407 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0706686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0932  putative outer membrane porin  40.69 
 
 		 407 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0227  putative outer membrane porin  40.69 
 
 		 407 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2009  outer membrane porin  40.69 
 
 		 407 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  40.92 
 
 		 383 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  38.56 
 
 		 418 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  37.35 
 
 		 403 aa  242  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  37.35 
 
 		 403 aa  242  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  40.05 
 
 		 380 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3848  porin  38.87 
 
 		 418 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2144  outer membrane protein  40.43 
 
 		 419 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0977931  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  39.9 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  38.78 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  40.05 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  38.82 
 
 		 471 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5889  porin  38.23 
 
 		 398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2370  outer membrane porin OpcP  38.44 
 
 		 419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  37.93 
 
 		 390 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  41.15 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  39.45 
 
 		 380 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  41.98 
 
 		 375 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  40.37 
 
 		 386 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  38.6 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  39.2 
 
 		 380 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  39.39 
 
 		 384 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  39.39 
 
 		 384 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  39.13 
 
 		 384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  39.13 
 
 		 384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  39.13 
 
 		 384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  38.27 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  38.94 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  39.35 
 
 		 379 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  39.06 
 
 		 411 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  38.62 
 
 		 384 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  39.84 
 
 		 386 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  38.44 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  41.01 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  39.66 
 
 		 387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  38.07 
 
 		 384 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  38.07 
 
 		 384 aa  225  8e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  38.07 
 
 		 384 aa  225  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  38.07 
 
 		 384 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  38.07 
 
 		 384 aa  225  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  38.07 
 
 		 384 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  38.07 
 
 		 384 aa  225  8e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  40.81 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  38.07 
 
 		 383 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  38.07 
 
 		 414 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4625  porin  39.47 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0866781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  36.55 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5151  porin  39.21 
 
 		 370 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  39.52 
 
 		 377 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  37.84 
 
 		 384 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  40 
 
 		 377 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  37.57 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  39.47 
 
 		 409 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5009  porin  38.38 
 
 		 370 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  38.38 
 
 		 384 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  39.36 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  37.3 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  37.3 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  37.3 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  37.3 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  38.32 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  39.8 
 
 		 381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5264  porin  37.86 
 
 		 370 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  37.77 
 
 		 386 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>