More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0014 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0014  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3918  transcriptional regulator, LysR family  95.99 
 
 		 299 aa  579  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.369694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3052  LysR family transcriptional regulator  83.61 
 
 		 299 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3334  LysR family transcriptional regulator  80.2 
 
 		 299 aa  461  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2989  LysR family transcriptional regulator  79.53 
 
 		 299 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2930  LysR family transcriptional regulator  79.53 
 
 		 299 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0203  LysR family transcriptional regulator  79.53 
 
 		 299 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1613  LysR family transcriptional regulator  79.53 
 
 		 299 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4072  LysR family transcriptional regulator  79.53 
 
 		 299 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3380  LysR family transcriptional regulator  79.53 
 
 		 299 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.771452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3998  LysR family transcriptional regulator  79.53 
 
 		 299 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0083  LysR family transcriptional regulator  83.22 
 
 		 299 aa  447  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0081  LysR family transcriptional regulator  83.22 
 
 		 312 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0072  LysR family transcriptional regulator  82.89 
 
 		 312 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0099  LysR family transcriptional regulator  82.21 
 
 		 312 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0081  LysR family transcriptional regulator  82.21 
 
 		 312 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2974  LysR family transcriptional regulator  82.21 
 
 		 312 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3262  LysR family transcriptional regulator  81.88 
 
 		 299 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0300  transcriptional regulator, LysR family  58.59 
 
 		 301 aa  329  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3373  LysR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 295 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0181  LysR family transcriptional regulator  57.1 
 
 		 314 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0988  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 310 aa  279  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3388  LysR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 305 aa  260  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.604965 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1198  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.369484  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2092  transcriptional regulator, LysR family  38.33 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03093  transcription regulator protein  41.08 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4798  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0115843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3456  transcriptional regulator, LysR family  37.04 
 
 		 296 aa  169  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192038  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2122  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.371996  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2178  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0263296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2130  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 		 292 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.175681  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1036  transcriptional regulator, LysR family  37.65 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1600  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 310 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2465  transcriptional regulator, LysR family  40.45 
 
 		 423 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2246  transcriptional regulator, LysR family  32.9 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.604756 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1329  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1905  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.204877 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4554  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 305 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5426  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.954201 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2823  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135524  normal  0.141091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6402  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 306 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1290  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2180  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.59 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1410  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.807333  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0928  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1388  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6793  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2678  DNA-binding transcriptional activator XapR  30.2 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0441451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2563  DNA-binding transcriptional activator XapR  30.2 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000012261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2784  DNA-binding transcriptional activator XapR  30.2 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00240936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2654  DNA-binding transcriptional activator XapR  30.2 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00016667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5612  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2612  DNA-binding transcriptional activator XapR  29.8 
 
 		 294 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0177144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2558  DNA-binding transcriptional activator XapR  28 
 
 		 294 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000632847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2660  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 321 aa  99.4  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1258  transcriptional regulator, LysR family  27.6 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000639687  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0963  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3633  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 328 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0989  transcriptional regulator, LysR family  32.7 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  30.16 
 
 		 298 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  31.42 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5919  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 332 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0217311  normal  0.163471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5293  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0620  LysR, substrate-binding  30.41 
 
 		 307 aa  96.7  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1312  LysR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 304 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1612  LysR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7296  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 309 aa  95.9  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal  0.377846 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 328 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 328 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  31.73 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5504  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0889  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 338 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1007  fhu operon transcription regulator  34.67 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000456933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0886  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 338 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0376917  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3479  transcriptional regulator, LysR family  32.93 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  32.09 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1638  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>