More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2178 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2178  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
292 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0263296  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2130  transcriptional regulator, LysR family  99.66 
 
 
292 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.175681  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1198  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.369484  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2122  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 
296 aa  187  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.371996  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2092  transcriptional regulator, LysR family  34.48 
 
 
298 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03093  transcription regulator protein  33.45 
 
 
297 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3373  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
295 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4798  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
304 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0115843  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1036  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 
291 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0988  LysR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
310 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3918  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 
299 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.369694  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0014  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3388  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.604965 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3334  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1600  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4072  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2930  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0203  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3998  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1613  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3380  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.771452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2989  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3052  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 
299 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0300  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 
301 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2246  transcriptional regulator, LysR family  31.82 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.604756 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0081  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3262  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0099  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2974  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0081  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0083  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0072  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 
312 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3456  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 
296 aa  112  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192038  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0181  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
314 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  27.35 
 
 
298 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1477  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
299 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.876533  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
316 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0044  LysR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1351  LysR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
325 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5919  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
332 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0217311  normal  0.163471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2180  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.92 
 
 
307 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15464  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4822  putative transcriptional regulatory protein (nitrogen assimilation control protein)  28.2 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.672498  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4649  LysR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
315 aa  93.2  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235656  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2037  transcriptional regulator, LysR family  28.2 
 
 
304 aa  93.2  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0223119  hitchhiker  0.000202643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2220  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
317 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  25.77 
 
 
308 aa  92.4  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
297 aa  92.4  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
323 aa  92  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0271  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
295 aa  92  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0648353  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4118  LysR family transcriptional regulator  26.43 
 
 
324 aa  92.4  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00686854  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2139  transcriptional regulator, LysR family  25.68 
 
 
293 aa  92  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487971  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 
303 aa  90.9  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.17 
 
 
304 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4130  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.28 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.717557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4781  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.28 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.749024  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3386  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.28 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1726  LysR family transcriptional regulator  25.29 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
297 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
296 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
296 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
298 aa  89.4  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0330  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 
336 aa  89.4  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
297 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1680  transcriptional regulator, LysR family  25.29 
 
 
293 aa  88.2  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1450  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 
297 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1646  LysR family transcriptional regulator  25.29 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01483  predicted DNA-binding transcriptional regulator  24.52 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2120  transcriptional regulator, LysR family  24.52 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01494  hypothetical protein  24.52 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26180  transcriptional regulator  25.17 
 
 
302 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1608  LysR family transcriptional regulator  24.52 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46170  LysR family transcriptional regulator  25.3 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0324298 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2132  LysR family transcriptional regulator  24.52 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54811  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  26.45 
 
 
298 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3926  putative transcriptional regulator  25.3 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3441  transcriptional regulator, LysR family  26.77 
 
 
297 aa  86.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.27 
 
 
293 aa  86.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2747  transcriptional regulator, LysR family  26.75 
 
 
305 aa  85.9  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437645  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5024  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 
311 aa  85.9  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0432035  normal  0.889367 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  29.74 
 
 
299 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17090  Transcriptional regulator, LysR family  27.8 
 
 
299 aa  85.9  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  29.74 
 
 
299 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
302 aa  85.5  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4465  transcriptional regulator, LysR family  33.84 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00192923  normal  0.232029 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  29.74 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  29.74 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2004  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  24.23 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>