More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1198 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1198  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.369484  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2130  transcriptional regulator, LysR family  41.92 
 
 
292 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.175681  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2178  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 
292 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0263296  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0014  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
299 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3918  transcriptional regulator, LysR family  43.48 
 
 
299 aa  225  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.369694  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2122  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 
296 aa  224  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.371996  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2092  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 
298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3334  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03093  transcription regulator protein  42.07 
 
 
297 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0300  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 
301 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2930  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
299 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1613  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
299 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0203  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
299 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3380  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
299 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.771452  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4072  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
299 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2989  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
299 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3998  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
299 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3052  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 
299 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0988  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0083  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4798  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0115843  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2974  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
312 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0081  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
312 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3262  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 
299 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0072  LysR family transcriptional regulator  41.08 
 
 
312 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3388  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 
305 aa  193  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.604965 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0081  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
312 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0099  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
312 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3373  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
295 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3456  transcriptional regulator, LysR family  36.08 
 
 
296 aa  186  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192038  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1036  transcriptional regulator, LysR family  37.33 
 
 
291 aa  185  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0181  LysR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
314 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1600  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2246  transcriptional regulator, LysR family  35.81 
 
 
321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.604756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 
303 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0963  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
294 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
306 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  29.83 
 
 
305 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  32.52 
 
 
303 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 
318 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2465  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 
423 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1131  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
310 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3114  transcriptional regulator, LysR family  28.16 
 
 
304 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 
302 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
298 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
316 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1769  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
291 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0244764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5612  LysR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
294 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1323  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
302 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
298 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
298 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4453  transcriptional regulator, LysR family  29.06 
 
 
298 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.47384 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4587  transcriptional regulator, LysR family  29.06 
 
 
298 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.781824  normal  0.831534 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
300 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  28.34 
 
 
300 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
305 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7296  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
309 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal  0.377846 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
308 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 
300 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  28.34 
 
 
300 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  30.95 
 
 
304 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4609  transcriptional regulator, LysR family  35.56 
 
 
289 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.461419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0184  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 
323 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
305 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
305 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  28.51 
 
 
300 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  28.34 
 
 
300 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0216  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
301 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  28.34 
 
 
300 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
298 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
328 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
328 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
297 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 
304 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
297 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
320 aa  99.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4050  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
308 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  27.46 
 
 
300 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  28.68 
 
 
306 aa  99.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  26.61 
 
 
297 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  30.95 
 
 
304 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  27.16 
 
 
300 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  30.95 
 
 
306 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
298 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
298 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6562  transcriptional regulator, LysR family  28.51 
 
 
296 aa  99  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  30.95 
 
 
306 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5884  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
296 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.279758 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  30.95 
 
 
306 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5520  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
296 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579894  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  30.95 
 
 
306 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  30.95 
 
 
306 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2367  transcriptional regulator, LysR family  32.73 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  27.02 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4972  transcriptional regulator, LysR family  28.51 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6244  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235646  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.038308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>