More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2465 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2465  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 423 aa  835    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3456  transcriptional regulator, LysR family  48.24 
 
 		 296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192038  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3918  transcriptional regulator, LysR family  40.45 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.369694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0014  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 299 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3052  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2122  transcriptional regulator, LysR family  36.63 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.371996  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2246  transcriptional regulator, LysR family  46.94 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.604756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0072  LysR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 312 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0083  LysR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 299 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2974  LysR family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 312 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0081  LysR family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 312 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3334  LysR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 299 aa  103  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2930  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 299 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0203  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 299 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3998  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 299 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3380  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 299 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.771452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2989  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 299 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4072  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 299 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1613  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 299 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3262  LysR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 299 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0099  LysR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 312 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0081  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 312 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3373  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 295 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2092  transcriptional regulator, LysR family  37.72 
 
 		 298 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1036  transcriptional regulator, LysR family  31.09 
 
 		 291 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1198  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 296 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.369484  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4798  LysR family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 304 aa  93.2  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0115843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3388  LysR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 305 aa  92  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.604965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1151  transcriptional regulator, LysR family  35.2 
 
 		 302 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03093  transcription regulator protein  38.6 
 
 		 297 aa  90.1  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2635  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 311 aa  89.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000430494  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6126  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2173  transcriptional regulator, LysR family  34.55 
 
 		 306 aa  82.8  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4431  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3365  LysR substrate-binding  34.64 
 
 		 320 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.415783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  34.66 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3748  LysR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.970136  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1877  transcriptional regulator, LysR family  36.16 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.018924  normal  0.0294674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3766  transcriptional regulator, LysR family  31.21 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.763855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2215  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.230967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3073  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2178  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0263296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  35.84 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2130  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.175681  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3085  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6604  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 315 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0988  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 310 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1600  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0677  putative transcriptional activator METR transcription regulator protein  33.51 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0439978  normal  0.107972 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1665  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5426  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.954201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2327  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4541  transcriptional regulator, LysR family  31.82 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  0.532762 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3469  transcriptional regulator, LysR family  31.82 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0811329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4630  LysR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  hitchhiker  0.000277503 
 
 
-
 
NC_004310  BR1498  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7296  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal  0.377846 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1893  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1449  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  38.89 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3425  DNA-binding transcriptional regulator CynR  38.89 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  40.3 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2464  DNA-binding transcriptional regulator CynR  38.89 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4959  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1243  DNA-binding transcriptional regulator CynR  38.89 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3323  DNA-binding transcriptional regulator CynR  38.89 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1027  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  34.62 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0383  DNA-binding transcriptional regulator CynR  38.89 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0300  transcriptional regulator, LysR family  31.67 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7137  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.31 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3752  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4592  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0476  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1323  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0330  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  47.92 
 
 		 297 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  37.41 
 
 		 295 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  37.41 
 
 		 295 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 305 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2953  LysR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 294 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2214  LysR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  37.41 
 
 		 295 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  37.41 
 
 		 295 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0664  LysR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 295 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  37.41 
 
 		 295 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  37.41 
 
 		 295 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 306 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5500  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>