More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1613 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2930  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
299 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3380  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
299 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.771452  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0203  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
299 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2989  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
299 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1613  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
299 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3998  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
299 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4072  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
299 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3334  LysR family transcriptional regulator  97.99 
 
 
299 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0014  LysR family transcriptional regulator  79.53 
 
 
299 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3918  transcriptional regulator, LysR family  78.52 
 
 
299 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.369694  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2974  LysR family transcriptional regulator  85.62 
 
 
312 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0072  LysR family transcriptional regulator  86.29 
 
 
312 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0081  LysR family transcriptional regulator  85.62 
 
 
312 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0083  LysR family transcriptional regulator  85.95 
 
 
299 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0099  LysR family transcriptional regulator  85.28 
 
 
312 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0081  LysR family transcriptional regulator  84.95 
 
 
312 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3262  LysR family transcriptional regulator  83.28 
 
 
299 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3052  LysR family transcriptional regulator  78.86 
 
 
299 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3373  LysR family transcriptional regulator  60.41 
 
 
295 aa  331  7.000000000000001e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0181  LysR family transcriptional regulator  56.13 
 
 
314 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0300  transcriptional regulator, LysR family  56.57 
 
 
301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0988  LysR family transcriptional regulator  48.78 
 
 
310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3388  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 
305 aa  265  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.604965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2092  transcriptional regulator, LysR family  40.4 
 
 
298 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1198  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
296 aa  201  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.369484  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03093  transcription regulator protein  41.75 
 
 
297 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4798  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
304 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0115843  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2122  transcriptional regulator, LysR family  36.79 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.371996  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3456  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 
296 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192038  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1036  transcriptional regulator, LysR family  39.27 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2130  transcriptional regulator, LysR family  31 
 
 
292 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.175681  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2178  transcriptional regulator, LysR family  31 
 
 
292 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0263296  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1600  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
310 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2246  transcriptional regulator, LysR family  32.05 
 
 
321 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.604756 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0928  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
304 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1410  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
304 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.807333  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6402  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1388  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.275315 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2465  transcriptional regulator, LysR family  41.57 
 
 
423 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4554  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1905  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
304 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.204877 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1329  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
304 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
297 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
310 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
320 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1290  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
309 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109093  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
298 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2558  DNA-binding transcriptional activator XapR  31.23 
 
 
294 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000632847  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
296 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
296 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
296 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
298 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
297 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0417087 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1258  transcriptional regulator, LysR family  30.83 
 
 
294 aa  103  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000639687  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
305 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
298 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
298 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6793  transcriptional regulator, LysR family  31.05 
 
 
319 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  29.53 
 
 
298 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2180  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.78 
 
 
307 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15464  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
306 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5612  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
294 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3691  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 
301 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2932  DNA-binding transcriptional activator XapR  28.07 
 
 
294 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000456471  normal  0.0988351 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 
298 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 
298 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2401  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
315 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
297 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3723  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
322 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  hitchhiker  0.00150053 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 
309 aa  98.2  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2654  DNA-binding transcriptional activator XapR  30.59 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00016667  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2660  LysR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2784  DNA-binding transcriptional activator XapR  30.59 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00240936  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2678  DNA-binding transcriptional activator XapR  29.53 
 
 
294 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0441451  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2612  DNA-binding transcriptional activator XapR  30.2 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0177144  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3114  transcriptional regulator, LysR family  30.62 
 
 
304 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2563  DNA-binding transcriptional activator XapR  30.2 
 
 
294 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000012261  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4050  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
308 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4089  transcriptional regulator, LysR family  30.18 
 
 
297 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  34.26 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  27.31 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
328 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
328 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2367  transcriptional regulator, LysR family  32.64 
 
 
301 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4836  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 
328 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 
314 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  24.01 
 
 
283 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
300 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5426  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 
294 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.954201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1743  transcriptional regulator, LysR family  30.04 
 
 
322 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
303 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3213  LysR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
283 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.146504  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1323  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
302 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0896  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0937961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1817  hypothetical protein  34.8 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.504025  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0706  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
341 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.897426  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
304 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0803  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
308 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>