More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03093 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03093  transcription regulator protein  100 
 
 		 297 aa  585  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2092  transcriptional regulator, LysR family  70.03 
 
 		 298 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1198  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.369484  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3918  transcriptional regulator, LysR family  41.75 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.369694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3373  LysR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 295 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0014  LysR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3334  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 299 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3052  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3388  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 305 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.604965 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1613  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3380  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.771452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2989  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2930  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0203  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3998  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4072  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4798  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0115843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0300  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0988  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2974  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0081  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3262  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 299 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0099  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 312 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0072  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0083  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0181  LysR family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0081  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 312 aa  175  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3456  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192038  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2130  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.175681  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2178  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0263296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2122  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.371996  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1036  transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1600  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2246  transcriptional regulator, LysR family  37.6 
 
 		 321 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.604756 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5919  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0217311  normal  0.163471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2180  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.93 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  28.15 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5097  transcriptional regulator, LysR family  28.15 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0208  LysR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  28.45 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0748  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0230  transcriptional regulator, LysR family  28.03 
 
 		 288 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2465  transcriptional regulator, LysR family  38.6 
 
 		 423 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6793  transcriptional regulator, LysR family  32.07 
 
 		 319 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0188  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 288 aa  99  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2086  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 307 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363313  normal  0.654508 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6126  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7296  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal  0.377846 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4716  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2323  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 307 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5426  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.954201 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6604  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4227  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 345 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1899  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 286 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.690335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 320 aa  96.3  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3619  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2941  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5027  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 303 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4657  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.933923 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1113  transcriptional regulator, LysR family  29.58 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2576  oxidative stress regulatory protein OxyR  32.62 
 
 		 319 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1168  oxidative stress regulatory protein OxyR  32.62 
 
 		 319 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2390  oxidative stress regulatory protein OxyR  32.62 
 
 		 319 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 300 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0307  oxidative stress regulatory protein OxyR  32.62 
 
 		 319 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1556  LysR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 309 aa  92.4  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00011369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0746  transcriptional regulator, LysR family  37.43 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  27.21 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4609  transcriptional regulator, LysR family  40.85 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.461419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2367  transcriptional regulator, LysR family  29.78 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  33.61 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0071  putative transcriptional regulator LysR-type  39.29 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0171  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 305 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0634  transcriptional regulator, LysR family  30.08 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6323  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482978  normal  0.771209 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2340  transcriptional regulator, LysR family  29.03 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2805  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1323  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3275  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812122 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2377  LysR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3737  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.440992 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3850  transcriptional regulator, LysR family  32.02 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 303 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 316 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>