116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4734 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  330  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  69.8 
 
 		 148 aa  209  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  70.07 
 
 		 144 aa  205  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  43.22 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  38.35 
 
 		 140 aa  95.5  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  41.88 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  41.03 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  43.22 
 
 		 134 aa  92.8  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  37.96 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  40 
 
 		 132 aa  92  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  92  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  37.21 
 
 		 133 aa  91.3  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  41.53 
 
 		 134 aa  91.3  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  41.53 
 
 		 134 aa  91.3  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  36.43 
 
 		 134 aa  90.9  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  37.96 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  34.96 
 
 		 141 aa  87.4  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  37.04 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  39.32 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  39.5 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  36.36 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  37.12 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  37.12 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  33.61 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  41.86 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  35.59 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0059  hypothetical protein  38.95 
 
 		 100 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0162758  normal  0.370913 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  33.61 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  33.64 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  32.5 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  31.67 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  32.17 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  30.08 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  28.95 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  29.01 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  28.57 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  27.97 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  29.63 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  29.84 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  28.7 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  26.42 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  30.43 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  26.42 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  26.42 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  26.72 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  30.61 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  30.77 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  31.37 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  26.05 
 
 		 197 aa  51.6  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  30.61 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  26.19 
 
 		 132 aa  51.2  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  30.61 
 
 		 136 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  25 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  25.71 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  27.12 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4039  hypothetical protein  27.88 
 
 		 120 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  25.4 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  25.37 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  21.23 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  25.21 
 
 		 185 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  31.13 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  28.95 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  26.55 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  28.95 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  27.52 
 
 		 195 aa  48.5  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  28.95 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  23.81 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02947  hypothetical protein  36.84 
 
 		 75 aa  47.8  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.597384  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  25.71 
 
 		 183 aa  47.4  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6225  hypothetical protein  33.04 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0551295  normal  0.629644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  25.81 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  25.81 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  28.12 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  25.81 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  27.59 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  23.7 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  22.96 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  26.23 
 
 		 228 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3691  hypothetical protein  27.45 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  25.23 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  25.4 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  23.3 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  26 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  22.86 
 
 		 247 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  25.5 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  25 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6794  hypothetical protein  32.69 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.144647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  22.96 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  26.5 
 
 		 133 aa  44.3  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0111  hypothetical protein  26.6 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  24.39 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  25.93 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5271  protein of unknown function DUF583  31.36 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.086995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1630  protein of unknown function DUF583  31.36 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0604  hypothetical protein  24.41 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.527043  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  22.86 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  23.33 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>