32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6794 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6794  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.144647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1630  protein of unknown function DUF583  45.16 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5271  protein of unknown function DUF583  45.16 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.086995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6225  hypothetical protein  44.83 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0551295  normal  0.629644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  33.9 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  33.9 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  30.47 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  33.06 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  34.29 
 
 		 152 aa  50.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  33.06 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  32.32 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  29.91 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  33.06 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  32.5 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  32.17 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  32.69 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  28.06 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  32.69 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  31.43 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  27.52 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  30.77 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  31.4 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  29.89 
 
 		 210 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  28.7 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  28.7 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  29.89 
 
 		 210 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  29.89 
 
 		 223 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  31.68 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  36.59 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  26.47 
 
 		 133 aa  40  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  32.39 
 
 		 171 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>