123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_08500 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  97.81 
 
 
137 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  65.93 
 
 
136 aa  184  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  37.98 
 
 
152 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  39.44 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  41.73 
 
 
148 aa  90.9  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  40.46 
 
 
164 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  37.4 
 
 
148 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  35.97 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  35.97 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  42.86 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  42.86 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  40.52 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  38.6 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  39.02 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  44.94 
 
 
118 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  40.5 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  33.06 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  34.71 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  32.03 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  33.57 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  30.83 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  30.83 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  32.48 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  33.91 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  29.32 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  36.05 
 
 
210 aa  62  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  36.05 
 
 
210 aa  62  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  36.05 
 
 
223 aa  62  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  31.67 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  35.19 
 
 
140 aa  60.1  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  36.36 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  29.08 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  28.8 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  35.71 
 
 
185 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  29.66 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  34.65 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0059  hypothetical protein  32.35 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0162758  normal  0.370913 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  29.2 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  31.37 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  29.03 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  34.69 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  31.63 
 
 
173 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  27.45 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  30.47 
 
 
131 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6794  hypothetical protein  33.9 
 
 
135 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.144647  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  31.63 
 
 
172 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  31.63 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  31.63 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  26.05 
 
 
154 aa  52.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  32.63 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  30.61 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4992  hypothetical protein  32.32 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.536213  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  30.61 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  30.61 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  28.12 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  30.08 
 
 
138 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  32.65 
 
 
106 aa  51.2  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  32.63 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  32.63 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  28.43 
 
 
183 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  31.03 
 
 
228 aa  50.1  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  26.47 
 
 
183 aa  50.1  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  28.89 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  31.73 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02948  hypothetical protein  55.56 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  26.27 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  30 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6225  hypothetical protein  31.68 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0551295  normal  0.629644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  30.48 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  28.57 
 
 
122 aa  47.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  28.71 
 
 
125 aa  47.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2530  hypothetical protein  29.31 
 
 
165 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0592189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  27.83 
 
 
143 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  23.85 
 
 
132 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  28.57 
 
 
128 aa  47  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0026  hypothetical protein  37.5 
 
 
361 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  32.04 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  26.96 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4039  hypothetical protein  31.63 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  26.53 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  31.11 
 
 
195 aa  45.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  33.33 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3711  protein of unknown function DUF583  33.33 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4993  hypothetical protein  28.57 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.37273  normal  0.0451267 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  29.29 
 
 
196 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  32.32 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  25.41 
 
 
202 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  31.82 
 
 
184 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  34.21 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  31.3 
 
 
123 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  27.18 
 
 
184 aa  44.7  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5271  protein of unknown function DUF583  28.07 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.086995  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  27.12 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1630  protein of unknown function DUF583  28.07 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  26.04 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  26.23 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  30.21 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>