20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4992 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_4992  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  298  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.536213  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  32.32 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  28.57 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  26.89 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  32.26 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  31.31 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  29.47 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  30.84 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  26.32 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  26.02 
 
 		 220 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  24.51 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  26.47 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1801  hypothetical protein  25.17 
 
 		 185 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  32.29 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  32.32 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  28.71 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  28.71 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  30.21 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  25 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  35.23 
 
 		 118 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>