109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0835 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  296  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  46.34 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  49.12 
 
 		 145 aa  106  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  49.12 
 
 		 145 aa  106  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  47.15 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  44.09 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  36.23 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  39.44 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  39.72 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  41.67 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  39.42 
 
 		 152 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  38.64 
 
 		 153 aa  86.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  37.84 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  37.84 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  37.84 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  36.61 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  40.59 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  33.96 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  35.71 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  36.63 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  38.61 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  34.55 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  37.25 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  37.25 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  36.89 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  35.64 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0059  hypothetical protein  36.05 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0162758  normal  0.370913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  40.48 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  34.62 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  34.31 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  32.67 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02947  hypothetical protein  44.44 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.597384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  24.39 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  27.52 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  29.41 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  28.37 
 
 		 185 aa  52  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  32.77 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  26.92 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  26.85 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  26.26 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  30.69 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  30.69 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  30 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  30.69 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  30.69 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  27.5 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  28.45 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6794  hypothetical protein  29.91 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.144647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  25.89 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  28.16 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  31.71 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  30.69 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  30 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  27.66 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02948  hypothetical protein  40.3 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  25.89 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  25.89 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  27.68 
 
 		 228 aa  47.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  24.35 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  25 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  22.22 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  22.22 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  22.22 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  29.13 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  29.13 
 
 		 278 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  26.85 
 
 		 270 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  26.85 
 
 		 269 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  21.21 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  26.85 
 
 		 267 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  24 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  28.28 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  28.3 
 
 		 262 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  28.3 
 
 		 262 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  28.7 
 
 		 282 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5104  protein of unknown function DUF583  30.43 
 
 		 199 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  31.4 
 
 		 220 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  29.03 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  29.52 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  26.26 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  31.52 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  30.25 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4992  hypothetical protein  26.47 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.536213  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  28.83 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  27.27 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4039  hypothetical protein  28.71 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  29.29 
 
 		 183 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  26.26 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  28.28 
 
 		 183 aa  42.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  31.52 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3692  hypothetical protein  26.67 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0882809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  21.37 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  25.74 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  27.78 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  24.22 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  26.92 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  25.53 
 
 		 195 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  26.92 
 
 		 122 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>