122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0597 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  236  6.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  35.29 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  40.2 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  34.19 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  32.41 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  32.41 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  33.04 
 
 
154 aa  77  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  35.51 
 
 
115 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  33.94 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  35.14 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  35.35 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  35.35 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  35.35 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  34.78 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  33.91 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  34.34 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  34.62 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  34.86 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  34.29 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  34.29 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3137  hypothetical protein  38.24 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  34.29 
 
 
131 aa  67  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  31.45 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  36.27 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  32.67 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  34.58 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  32.41 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  29.29 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  28.07 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  33.01 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  28.71 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  32.69 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  31.31 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  32.73 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  31.48 
 
 
134 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  31.48 
 
 
134 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  32.43 
 
 
148 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  33.01 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0236  hypothetical protein  32.32 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00758504  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  31.43 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  30.56 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  31.45 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  31.68 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  29.52 
 
 
195 aa  58.5  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  29.63 
 
 
203 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  34.23 
 
 
197 aa  58.9  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  34.26 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  28.16 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  30.69 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  30.97 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  30.97 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1888  hypothetical protein  30.48 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000131762  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  27.43 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  32.46 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  32.43 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0548  hypothetical protein  26.53 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0350066  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  31.37 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  27.45 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  27.45 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  32.99 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  29.09 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  30.36 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  32.65 
 
 
195 aa  54.3  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  36.08 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  52.8  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  29.41 
 
 
149 aa  52.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  31.37 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  29.81 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  30.69 
 
 
191 aa  51.6  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  29.17 
 
 
131 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  28.89 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  32.32 
 
 
173 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  25.71 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  25 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  35.19 
 
 
131 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  30.56 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  27.27 
 
 
218 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  27.88 
 
 
128 aa  50.4  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  25.96 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  27.12 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  26.92 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  30.63 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  27.88 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  28.85 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  29.81 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  27.88 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3711  protein of unknown function DUF583  27.88 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  32.94 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  28.12 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  30.77 
 
 
172 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  29.79 
 
 
202 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0308  protein of unknown function DUF583  34.38 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000311103  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0111  hypothetical protein  33.66 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  30.77 
 
 
172 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  30.77 
 
 
172 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  26.92 
 
 
191 aa  47  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.484596 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>