49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4039 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007488  RSP_4039  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  231  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  38.83 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  37.29 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  37.76 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  39.45 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  39.45 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  32.14 
 
 		 197 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  35.51 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  34.34 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  35.11 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2530  hypothetical protein  36.89 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592189 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4474  hypothetical protein  38.05 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  29.29 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  29.91 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  29.63 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  29.63 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  29.63 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  36.63 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  36.63 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  33.02 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  29 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  33.01 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  35.29 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  28.57 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  28.85 
 
 		 144 aa  52  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  29.81 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  22.45 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  29.79 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  27.88 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  29.47 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  31.82 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  21.7 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  26.51 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  23.36 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  33.66 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  31.63 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  28.72 
 
 		 202 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  28.85 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  31.63 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  32.69 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  32.43 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  29.13 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  28.71 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  23.96 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  25.77 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  27.18 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  28.43 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  24.49 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  27.91 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>