98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2611 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  303  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  98.65 
 
 		 148 aa  299  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  86.39 
 
 		 147 aa  261  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  84.5 
 
 		 135 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  70.87 
 
 		 137 aa  186  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  66.4 
 
 		 149 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  66.4 
 
 		 149 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  66.4 
 
 		 149 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  66.4 
 
 		 149 aa  176  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  44.09 
 
 		 141 aa  117  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  45.69 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  43.28 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  44.12 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  44.35 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  43.52 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  38.66 
 
 		 171 aa  92  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  44.44 
 
 		 267 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  43 
 
 		 262 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  44.44 
 
 		 269 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  43 
 
 		 262 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  44.44 
 
 		 270 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  44.44 
 
 		 173 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  39.39 
 
 		 282 aa  86.3  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  39.39 
 
 		 265 aa  84.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  36.73 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  33.64 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  31.91 
 
 		 183 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  35.42 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  32.98 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  30 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  31.13 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  34.38 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  28.83 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  28.45 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  31.31 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  33.68 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  33.68 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  33.68 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  32.2 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  30.17 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  33.04 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  31.07 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  27.52 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  27.66 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  31.48 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0604  hypothetical protein  31.93 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.527043  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  31.58 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  31.87 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  30.53 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  29.47 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  26.5 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  26.23 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  31.87 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  25.83 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  26.85 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  26.32 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  30.53 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  27.18 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  24.29 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  27.18 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  27.1 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  26.85 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  28.89 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  25.69 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  23.7 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  28.89 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2505  hypothetical protein  33.75 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  24.74 
 
 		 191 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  26.36 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  25.89 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5104  protein of unknown function DUF583  23.97 
 
 		 199 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  26.61 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  27.68 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  24.35 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3137  hypothetical protein  28.75 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  26.67 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  29.89 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  23.87 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  26.32 
 
 		 115 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  25 
 
 		 173 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3691  hypothetical protein  25.78 
 
 		 178 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  24.21 
 
 		 132 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  28.26 
 
 		 148 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  27.27 
 
 		 247 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  23.48 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  23.48 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  26.77 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  30.68 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  26.13 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  24.73 
 
 		 195 aa  41.2  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  26.04 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  30.49 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  25.53 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  27.59 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  22.68 
 
 		 172 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1567  hypothetical protein  24.68 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  25.41 
 
 		 220 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>