28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02947 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02947  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.597384  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  74.67 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  74.67 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  75.32 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  50.65 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  45.33 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  45.45 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  51.61 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  46.05 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  42.86 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  44.74 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  42.11 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  40.79 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  44.44 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  41.94 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  37.33 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  38.67 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  33.33 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  37.33 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  33.33 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  36.84 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  33.87 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  31.88 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  40 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  36.71 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  31.88 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  31.88 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>