106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1045 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  299  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  49.26 
 
 
152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  45.6 
 
 
148 aa  111  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  46.22 
 
 
144 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  41.35 
 
 
164 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  36.23 
 
 
149 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  39.83 
 
 
145 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  39.83 
 
 
145 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  43.7 
 
 
153 aa  97.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  40.48 
 
 
134 aa  97.1  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  37.06 
 
 
154 aa  95.9  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  40.48 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  40.48 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  39.39 
 
 
133 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  34.65 
 
 
136 aa  92  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  39.02 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  37.96 
 
 
160 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  88.6  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  37.4 
 
 
140 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  37.04 
 
 
132 aa  88.6  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  37.4 
 
 
137 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  37.04 
 
 
132 aa  88.6  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  35.48 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  36.29 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  39.5 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  36.64 
 
 
140 aa  83.6  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  37.31 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  37.59 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  39.55 
 
 
148 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  37.5 
 
 
118 aa  72  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02947  hypothetical protein  45.33 
 
 
75 aa  67  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.597384  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0059  hypothetical protein  40.23 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0162758  normal  0.370913 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  31.3 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  32.73 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  32.32 
 
 
138 aa  60.8  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  28.71 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  29 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  26.32 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  26.32 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  26.09 
 
 
184 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  28.71 
 
 
185 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  29.52 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  26.4 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  30.43 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  31.58 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  29.01 
 
 
187 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  26.52 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  30.1 
 
 
183 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  30.61 
 
 
145 aa  54.3  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  24.75 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  24.75 
 
 
140 aa  53.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  24.75 
 
 
140 aa  53.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  25.4 
 
 
157 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  30.97 
 
 
122 aa  53.5  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  28.16 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  27.97 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  28.95 
 
 
116 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  27.73 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  29.2 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  27.62 
 
 
185 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  32.17 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  29.9 
 
 
172 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  27.73 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  29.9 
 
 
172 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  29.9 
 
 
172 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  32.17 
 
 
122 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3711  protein of unknown function DUF583  32.17 
 
 
122 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  26.89 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  28.71 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  22.76 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  28.07 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  26.61 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  27.78 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  29.46 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3692  hypothetical protein  32.38 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0882809  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  29.29 
 
 
145 aa  48.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  28.16 
 
 
195 aa  47.8  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  26.45 
 
 
220 aa  47.4  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  28.42 
 
 
197 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  27.87 
 
 
137 aa  47.4  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  27.59 
 
 
161 aa  47.4  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  25.25 
 
 
131 aa  47  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  28.97 
 
 
228 aa  46.2  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3691  hypothetical protein  25.74 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218067  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3137  hypothetical protein  26.92 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  30 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  29.59 
 
 
202 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02948  hypothetical protein  29.23 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  27 
 
 
119 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  27 
 
 
119 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  28 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6794  hypothetical protein  30 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.144647  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  29.59 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  26.26 
 
 
196 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3570  hypothetical protein  25 
 
 
180 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  32.58 
 
 
210 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  32.58 
 
 
210 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  32.58 
 
 
223 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3636  protein of unknown function DUF583  25 
 
 
179 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.641699  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3710  protein of unknown function DUF583  25 
 
 
179 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>