110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6606 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  100 
 
 
157 aa  319  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  39.84 
 
 
161 aa  101  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  38.06 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  44.76 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  42.42 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0308  protein of unknown function DUF583  36.63 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000311103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  32.54 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  37.08 
 
 
195 aa  62.8  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  27.74 
 
 
185 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  60.5  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  29.75 
 
 
139 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  31.43 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  33.98 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  28.93 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  34.02 
 
 
159 aa  58.9  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  29.2 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  27.34 
 
 
184 aa  57.4  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  30.61 
 
 
125 aa  57.4  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  30.1 
 
 
123 aa  57.4  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  31.31 
 
 
145 aa  57.4  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  34.31 
 
 
191 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  34.38 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  28.91 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  27.94 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  30.91 
 
 
113 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  29.82 
 
 
220 aa  54.7  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  29.41 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  32.32 
 
 
129 aa  53.9  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  33.98 
 
 
106 aa  53.9  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  29.59 
 
 
202 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  29.59 
 
 
138 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  32 
 
 
116 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  24.53 
 
 
119 aa  52.4  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  29.81 
 
 
131 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  29.06 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  25.25 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  27.21 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  29.59 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  29.59 
 
 
136 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  32.67 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  25.25 
 
 
140 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  23.97 
 
 
187 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  25.25 
 
 
140 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  30.72 
 
 
210 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  30.72 
 
 
210 aa  50.8  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  26.43 
 
 
218 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  30.72 
 
 
223 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  32.2 
 
 
197 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0111  hypothetical protein  24.74 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  29.46 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  29.46 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  26 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  30.48 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  28.57 
 
 
137 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  30.1 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  31.07 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3711  protein of unknown function DUF583  31.07 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  30.39 
 
 
133 aa  47.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  26.32 
 
 
119 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  26.77 
 
 
171 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  20.95 
 
 
203 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  30.61 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  26.32 
 
 
119 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  25.96 
 
 
158 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  30.69 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  25.86 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  25.89 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  25.4 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  26.77 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  25.71 
 
 
228 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  27.39 
 
 
183 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  27.68 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3692  hypothetical protein  30.1 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0882809  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  31.31 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  25 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  24.3 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  24.62 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  28.93 
 
 
195 aa  44.3  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  25.24 
 
 
265 aa  44.3  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  28.28 
 
 
184 aa  43.9  0.0009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  29.81 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  26.53 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  26.36 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  24.24 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  27.27 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  30.11 
 
 
131 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  26.36 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  24.24 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  23.87 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  29.27 
 
 
140 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  26 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  29.27 
 
 
137 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  27.18 
 
 
270 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  27.18 
 
 
267 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  26.67 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  30.3 
 
 
134 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  23.01 
 
 
191 aa  42.4  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  23.87 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  23.78 
 
 
185 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  28.21 
 
 
135 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>