101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0308 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0308  protein of unknown function DUF583  100 
 
 		 152 aa  299  9e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000311103  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  34.07 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  35.45 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  35.29 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  36.63 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  37.01 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  35.11 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  32.31 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  28.57 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  38.83 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  29.57 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  30.61 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  25.66 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  29.55 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  33.67 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  37.62 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  30.39 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0111  hypothetical protein  29.17 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  33.67 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  30.77 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  30.77 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  30.77 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3691  hypothetical protein  25.74 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  32.43 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  32.43 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  32.43 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  34.69 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  30.71 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  32.65 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  28.57 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  30.56 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3692  hypothetical protein  28.07 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0882809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3570  hypothetical protein  27.45 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  31.11 
 
 		 195 aa  52.4  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  28.7 
 
 		 203 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3636  protein of unknown function DUF583  27.45 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.641699  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3710  protein of unknown function DUF583  27.45 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  24.81 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  34.09 
 
 		 195 aa  51.2  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  27.45 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  27.45 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3711  protein of unknown function DUF583  27.45 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  27.27 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1928  hypothetical protein  27.84 
 
 		 220 aa  50.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.284182 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  30.39 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  31.58 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  27.84 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  25.64 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  31.31 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  27.01 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  34.38 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  28.71 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  32.97 
 
 		 184 aa  47.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1308  protein of unknown function DUF583  27.55 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.677275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  29.47 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  26.92 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1707  hypothetical protein  30.77 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.195534  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  22.3 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0548  hypothetical protein  23.23 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0350066  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  32.65 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  25.18 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  32.79 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  23.89 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0430  hypothetical protein  30.3 
 
 		 183 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  28.71 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  29.41 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  30.43 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  31.63 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  29.36 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  29.77 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0290  hypothetical protein  32.81 
 
 		 185 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3896  hypothetical protein  28.79 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2786  hypothetical protein  29.79 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  23.53 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  27.07 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  28.28 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  25.25 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4081  hypothetical protein  27.55 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  30.69 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  36.36 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2060  protein of unknown function DUF583  28.28 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  27.05 
 
 		 147 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  27.27 
 
 		 132 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  27.72 
 
 		 152 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  27.27 
 
 		 132 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5284  protein of unknown function DUF583  31.25 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  27.55 
 
 		 154 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  31.73 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  27.33 
 
 		 228 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  27.08 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2478  hypothetical protein  28.28 
 
 		 203 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  28.32 
 
 		 210 aa  41.2  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  28.32 
 
 		 210 aa  41.2  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  26.45 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  31.63 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  28.78 
 
 		 223 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  26.73 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>